文明6中除了通过战争摧毁对方的军队来达成胜利之外，还有另一种隐藏且策略性更强的方式，那便是通过文化、压迫力、间谍等多方面的威胁，让敌方的城市对你叛变，从而轻松掌握对方的城市。
通过游戏的内政系统允许玩家通过中央政权对其他城市进行威胁，包括税收、制裁、政治压迫等手段，进一步潜移默化的影响其他城市的民心。你可以对别的城市运用强大的经济力量，逐步降低他们的经济繁荣度，让他们在经济上对你产生依赖。还可以善用游戏的宗教系统，积极推广自己的宗教，培养他们对你的信任甚至崇拜，让他们心甘情愿地归顺。
部署间谍是让对手城市叛变的一种非常有效的策略，间谍扮演了一个极为重要的角色，他们可以进行各种隐秘活动，包括在目标城市进行破坏，或者煽动叛乱，扰乱对方的社会秩序，引发内乱，从而达到让对方城市叛变的目的。只要正确使用间谍，就能让敌对势力陷入混乱，轻而易举地掌控他们的领土。荣誉系统也是一个重要的让城市叛变的工具，每个城市都有一个荣誉值，当这个值降到一定程度时，便会引发叛乱。玩家可以通过各种手段，如战争、经济制裁、文化影响等，降低其荣誉值，从而促使城市叛变。值得注意的是，荣誉值通常与城市的繁荣程度、安全情况及满意度等因素相关，掌握这些因素，便可从内部瓦解城市，让其自动归顺。
