ggplot2高效实用指南

文章较长点击直达我的博客,浏览效果更好。本文内容基本是来源于STHDA,这是一份十分详细的ggplot2使用指南,因此我将其翻译成中文,一是有助于我自己学习理解,另外其他R语言爱好者或者可视化爱好者可以用来学习。翻译过程肯定不能十全十美,各位读者有建议或改进的话,十分欢迎发Email(tyan@zju.edu.cn)给我。

ggplot2是由HadleyWickham创建的一个十分强大的可视化R包。按照ggplot2的绘图理念,Plot(图)=data(数据集)+Aesthetics(美学映射)+Geometry(几何对象):

在ggplot2中有两个主要绘图函数:qplot()以及ggplot()。

由ggplot2绘制出来的ggplot图可以作为一个变量,然后由print()显示出来。

根据数据集ggplot2提供不同的方法绘制图形,主要是为下面几类数据类型提供绘图方法:

安装ggplot2提供三种方式:

加载

本文将使用数据集mtcars。

qplot()类似于R基本绘图函数plot(),可以快速绘制常见的几种图形:散点图、箱线图、小提琴图、直方图以及密度曲线图。其绘图格式为:

其中:

也可以添加平滑曲线

还有其他参数可以修改,比如点的形状、大小、颜色等

箱线图

小提琴图

点图

直方图

密度图

上文中的qplot()绘制散点图:

在ggplot()中完全可以如下实现:

改变点形状、大小、颜色等属性

绘图过程中常常要用到转换(transformation),这时添加图层的另一个方法是用stat_*()函数。下例中的geom_density()与stat_density()是等价的

等价于

使用数据集wdata,先计算出不同性别的体重平均值

先绘制一个图层a,后面逐步添加图层

可能添加的图层有:

改变颜色

可以通过修改不同属性如透明度、填充颜色、大小、线型等自定义图形:

使用以下函数:

根据sex修改颜色,将sex映射给line颜色

修改填充颜色以及透明度

添加均值线以及手动修改颜色

将sex映射给颜色

手动修改颜色

y轴显示为密度

修改颜色以及线型

将sex映射给线颜色

修改填充颜色

使用数据集mtcars,先创建一个ggplot图层

可能添加的图层有:

将变量cyl映射给点的颜色和形状

自定义颜色

可以添加回归曲线

散点图+回归线

使用loess方法

将变量映射给颜色和形状

使用数据集faithful

实际上geom_jitter()是geom_point(position=jitter)的简称,下面使用数据集mpg

增加抖动防止重叠

其中两个参数:

参数label用来指定注释标签

使用数据集diamonds

创建ggplot图层,后面再逐步添加图层

可添加的图层有:

geom_bin2d()将点的数量用矩形封装起来,通过颜色深浅来反映点密度

设置bin的数量

geom_hex()依赖于另一个R包hexbin,所以没安装的先安装:

修改bin的数目

主要是如何通过线来连接两个变量,使用数据集economics。

先创建一个ggplot图层,后面逐步添加图层

可添加的图层有:

使用数据集ToothGrowth,其中的变量len(Toothlength)是连续变量,dose是离散变量。

创建图层

可添加的图层有:

添加有缺口的箱线图

按dose分组映射给颜色

将dose映射给填充颜色

按supp进行分类并映射给填充颜色

添加中值点

与箱线图结合

将dose映射给颜色进行分组

添加中值点

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