广州地铁3号线01号车番禺广场，首班往天河客运站6:00，末班往天河客运站22:55。02号车市桥，首班往番禺广场6:17，首班往天河客运站06:03，末班往番禺广场0:03，末班往天河客运站22:57。
广州地铁3号线，线路起于天河客运站，途经天河区、海珠区和番禺区，贯穿新中轴线区域、番禺区新城区等区域，止于番禺广场站；北延段起于体育西路站，途经天河区，白云区和花都区，止于机场北站，地铁大致呈南北“Y字形”走向。
广州地铁三号线运行模式
在工作日早高峰时段开行“番禺广场至同和”小交路。高峰时段有同和至大石单向早高峰短线，乘客无须从北延段换乘主线，直接从三北线的同和站可达到主线大石站。
2016年9月1日起，在23:15开行一趟机场南往体育西路方向的夜间专车，专车沿途只停靠嘉禾望岗站、同和站、广州东站、体育西路站4个车站。
2019年1月21日起，广州地铁3号线在天河客运站至番禺广场、机场北至体育西路开行双向交路的基础上，将在工作日日间非高峰期（机场北至体育西路段约9:30-16:00，天河客运站至番禺广场段约10:00-6:30）和节假日全天试行机场北至番禺广场双向直通交路。
2020年2月24日起，广州地铁3号线在早高峰期间试行“机场北至番禺广场”双向直通列车。
