《九州海上牧云记》大结局是：
合戈希望薛或能助其弑君，他许诺薛或日后荣华富贵，让其泽被子孙。薛或并不相信合戈口头之言，不肯答应。合戈诚挚道出，天下在他心中已是一个残梦。
但皇后一生刚强，根本受不了天牢之苦，经过这么多事情，他已经明白没有权力的皇子，根本什么都不是。经过合戈的一番话语，薛或点头答应弑君之事，但他要求合戈自己找人动手。
《九州海上牧云记》的拍摄过程：
2015年8月30日，《九州海上牧云记》在新疆那拉提草原正式开机。2016年5月27日，摄制组经过270个拍摄日，在日本滋贺彦根古城宣布杀青。
从筹备到杀青历时2年，全组工作人员最高达1000人，演职人员出演超50000人次；道具陈设占地面积60000平方米，兵器超12000件，马具超500套。
梳妆道具制作工时累计达36000小时，角色设计170个，服装手稿约20000张，共制作10500件服装，制作过程长达1年，其中单套服装制作工时超过330小时，羽毛5000余片。
