98式采用先进的计算机稳像式火控系统，包括热成像仪、稳定式测距瞄准具、弹道计算机、车长控制面板、横风传感器、倾斜传感器、角速度传感器等。其炮塔左后方的组合式光电系统，包括有热成像仪和激光测距机，它的出现表明我国坦克的夜视夜瞄能力有了突破性的进展。火控系统的反应时间小于6秒。由于采用了先进的计算机稳像式火控系统，使得98式坦克具备了在行进中对活动目标的射击能力，首发命中率在90%以上。
采用了国际上先进而流行的猎－歼式火控系统（也称双指挥仪式），其最显著的特点是，车长可以对火控系统进行超越（炮长的）控制，包括射击、跟踪目标和指示目标等；在坦克炮塔后部装有激光目眩压制干扰装置。最大作用距离4000米。夜战能力方面装有我国第二代凝视焦平面热成像仪，夜间或复杂气象条件下，对坦克目标观察距离达7～9公里，平均无故障时间为4000小时，在能见度只有100米左右的恶劣环境中对目标的发现距离为4，000米，识别距离为3，100米，具备了在昼/夜间于运动状态下对运动目标射击能力。
