外来物种入侵的危害有：破坏生物多样性、破坏生态平衡、可能携带病原微生物。
1、破坏生物多样性
外来物种入侵是生物多样性的头号敌人。入侵物种被引入异地后，由于其新生环境缺乏能制约其繁殖的自然天敌及其他制约因素，迅速蔓延，大量扩张，形成优势种群，并与当地物种竞争有限的食物资源和空间资源，直接导致当地物种的退化，甚至灭绝。
2、破坏生态平衡
外来物种入侵，会对植物土壤的水分及其他营养成分，以及生物群落的结构稳定性及遗传多样性等方面造成影响，从而破坏当地的生态平衡。
3、可能携带病原微生物
对其他生物生存甚至对人类健康构成直接威胁如起源于东亚的“荷兰榆树病”曾入侵欧洲，并于1910年和1970年两次引起大多数欧洲国家的榆树死亡。
入侵途径
外来入侵物种进入中国的途径主要分为两种：一种是无意引入，一般是随国际贸易无意进入我国，比如随苗木和插条引进的杨树花叶病毒，随进口粮油、货物或行李裹挟偶然带入的长芒苋，通过自然扩散从东南亚进入我国的紫茎泽兰等。
另一种是有意引进，包括作为蔬菜引进的尾穗苋、苋、茼蒿，作为观赏物种引进的加拿大一枝黄花、巴西龟，作为药用植物引进的洋金花，作为养殖品种引入的福寿螺、牛蛙，作为草坪草或牧草引进的地毯草、扁穗雀麦等。
