首先一周目可入手的MEGA石：
御三家不说了身上带着的通关后ミレアシティ的石头房子里100万一个能买
卢卡里奥剧情获得
火鸡官方配信带的（读档下面那个奇妙的礼物选项获得）
化石研究场送的
クエノシティ的西北方的奇异现象狂热者（オカルトマニア）送的
前往海神の穴的路上一个小岛上的老头送的
冰之洞穴打倒傻帽团后跟雪男对话获得
二周目可获得：
通关后前往ミレアシティ南边的绿色咖啡店跟冠军随便交换个宠物他交给你的拉鲁拉斯身上自带
(前x后y)神奇宝贝村的ななしの洞窟跟超梦对战后会掉在地上强制拾取.....（打死会不会出现我没试过....）
然后接下来的MEGA石要触发任务后在每天晚上8点到9点一个小时内才能入手，首先通关后博士找你去ミアレシティ的ミアレステーション（找不到的飞过去后打车），会给你车票然后转身坐车来到キナンシティ然后下车会得到对战记录器，之后去那个城的正中央的バトルハウス（对战房）进行一次对战，之后出来以后去这个城最上面这时劲敌会出现在那里跟他对战后他会送你。
的MEGA石之后告诉你博士在ヒャッコクシティ広场的日时计那里找你
飞过去跟博士对话触发剧情后博士告诉你因为那个最终兵器什么的导致日时计发光然后每天晚上8点开始的一个小时内他会照出隐藏的MEGA石，之后就可以收集以下的石头了，一定要在晚上8点到9点可以改3DS时间反正我就是这么干的..
冠军之路路上加血那个人的左面有可用碎石击碎的墙进去后地上发光的就是（需要带会碎岩的怪）
前X后Y在ショウヨウシティ的精灵会馆里第一个训练师那里绕到后面去爬上去发光的就是
コボクタウン的ショボンヌ城里（不是抓狗那城飞过去往上走）左侧走上二楼地上发光的就是
クノエシティ的水井边上
映し身の洞窟地下二层最里面发光的地上
前X后Y从2号路进入ハクダンの森进去后直走草丛里
前X后Y16号路荒れ果てホテル出来往下走一群骑车的绕着走的中央发光的就是（去的时候也许需要怪力推石头最好带上）
空ろの间最里面就是（去的时候需要攀瀑从瀑布下到空ろの间带上攀瀑的怪）
之前冰雪洞窟的雪男背后的石头那里发光的就是
辉きの洞窟骑犀牛过去那洞窟进去后第一个岔路右拐走到头发光的就是
レンリタウン的东南方三个瀑布中间那里发光的就是就是卖水奸商那个位置
