1、登场人物标注：
s：雷司、Z：真司、C：阿驯、S：尚志、W：小望、j：健悟、P：考平、G：银河队、J：神奇宝贝猎人J、N：竹兰、L：乌拉拉、B：神奇宝贝保育家、M：小茂
2、倾斜体为总集篇。.
3、小遥仅在第76~79集客串，不再另外标注。
岩石系道馆
DP01.出发从双叶镇到真砂镇（小光登场并得到波加曼，看到艾姆利多）
DP02.寻找皮卡丘！202号道路！（小次郎得到尖牙笼，小智收服姆克儿，小刚归队）Z
DP03.对战劲敌三对三!（小光加入，真司登场）Z
DP04.波加曼对战含羞苞小光的初次对战！（尚志登场）S
DP05.收服草苗龟！（小智收服草苗龟）
DP06.迷幻之森！再次遇见真司!!Z
DP07.波加曼加油！
DP08.神秘道馆里的不良蛙！（小刚得到不良蛙）
DP09.和卷卷耳一起玩！（小光收服卷卷耳）
DP10.神奇宝贝表难以入手!?
DP11.小光！华丽大赛初登场W
DP12.华丽大赛战斗!劲敌对决! W
DP13.姆克儿加油!（小刚的爱哭树学会模仿，小智的姆克儿进化成姆克鸟并学会回转攻）
DP14.一切交给小刚吧!（小刚的爱哭树进化成胡说树）
DP15.钢铁道馆!瓢太对战真司!Z
DP16.头盖龙VS皮卡丘!
DP17.古代神奇宝贝大进击!
DP18.再战钢铁道馆!决战战槌龙！（小智得到煤炭徽章）
草系道馆
DP19.收服到帕奇利兹……就没问题了?（小光收服帕奇利兹）
DP20.神奇宝贝猎人J!J（猎人J登场）
DP21.最强的鲤鱼王与最美的笨笨鱼!
DP22.帕奇利兹VS长尾怪手!华丽对战赛!
DP23.大钢蛇失控！守护大牙狸的村落!!
DP24.小智对抗皮卡丘!?
DP25.怪杰罗丝雷朵与花之传说!
DP26.神奇宝贝华丽大赛苑之大会!（健悟登场，小光的波加曼学会潮漩）j
DP27.决战，波加曼对波皇子!（小光得到缎带）j
DP28.飘飘球与北风的使者!
DP29.小智与小光，双人合作赛没问题!?
DP30.百代森林，结草儿进化作战!
DP31.草苗龟对草苗龟！速度对决!
DP32.琥珀之城的蜂后!
DP33.我喜欢!神奇宝贝扮演大会！（小刚得到神奇宝贝蛋）
DP34.泳气鼬!通向最强的道路！（小光收服泳气鼬）
DP35.四天王悟松与青铜钟!
DP36.神奥时空传说!S/G
DP37.百代道馆！对战菜种!（小智得到森林徽章）
格斗系道馆
DP38.爆诞!单车路!!（小刚的蛋孵化成好运蛋）
DP39.皮卡丘留守记!
DP40.冠军竹兰登场！N/Z
DP41.小光和小望与双人表演！W
DP42.落雷兽训练中心！
DP43.梦妖魔！从恶梦中逃脱！
DP44.帮助迷路的怪河马！
DP45.猎人J再次登场！守护盾甲龙J/M
DP46.迷宫内大洗牌！全员齐心协力！Z
DP47.小麦与凯西与水底！
DP48.小智与小光！迎向新的冒险!!Z
DP49.神奇宝贝华丽大赛！缘之大会！S/W
DP50.全员参加！双打对战！Z/P
DP51.小火焰猴VS猫鼬斩！命运的对决！Z/P
DP52.双打对战！最终对决!!（小智得到小火焰猴）Z/P
DP53.小火焰猴的眼泪!Z
DP54.菜种与沙漠奈亚！再见是为了谁！（小次郎的沙漠奈亚离队）
DP55.长尾怪手与泳气鼬！各自的道路！！（小光的泳气鼬和小智的长尾怪手交换）W
DP56.花岩怪的楔石!
DP57.大尾狸早就知道了！
DP58.大朝北鼻！热血之魂！
DP59.伦琴猫之瞳！
DP60.随意遗迹的未知图腾！（小光的长尾怪手学会双重攻击并进化成双尾怪手）G
DP61.神奇宝贝华丽大赛随意大会!!（武藏得到缎带）W/j
DP62.女仆咖啡店的大奶罐！（小刚的好运蛋学会神秘力量）
DP63.小山猪三重奏与温泉雾气对战！
DP64.天蝎王与天蝎!冲出风之迷宫!（小智收服天蝎，草苗龟学会能源球）Z
DP65.帕奇利兹在河马兽的口中!?
DP66.路卡利欧愤怒的波导弹s
DP67.小光的第一场道馆赛！（小智的姆克鸟学会神鸟特攻）s
DP68.帷幕道馆！路卡利欧对泳气鼬！！（小智的泳气鼬学会水波动，小智得到格斗徽章）s
水系道馆
DP69.新潮打扮！其名为银河队!!G
DP70.振作起来铃铛响！
DP71.神奇宝贝保育家！波导的利欧路!（前篇）B/J
DP72.神奇宝贝保育家！波导的利欧路!（后篇）B/J
DP73.再见了毒粉蝶！（武藏的毒粉蝶离队）
DP74.皮卡丘!雷丘！通向进化的道路！！Z
DP75.华丽大赛大师米可利登场!!
DP76.七星级七星饭店!靠双打对战吃到全餐!!（小遥归队）
DP77.大家都是劲敌！米可利杯!!WZ
DP78.激战！各自的战斗!!W（小智看见亚克诺姆）
DP79.决战！小光对小遥!!W（小光得到缎带，小遥离队）
DP80.阳阳玛！收服作战!!（武藏收服阳阳玛，阳阳玛学会原始之力进化成梅卡阳玛）
DP81.灼热的小火焰猴!Z
DP82.湿原大湿地的不良蛙庆典!？
DP83.湿原道馆！VS极限假面!!（小智得到沼泽徽章）
幽灵系道馆
DP84.羡慕先生家的大胃王小山猪！（小光得到小山猪）
DP85.天蝎！友情之翼!!（小智的天蝎进化成天蝎王）M
DP86.缘之时装大会！通往神奇宝贝风格师之路!!
DP87.路霸可达鸭!
DP88.神奇宝贝暑期讲座开课!P
DP89.研究报告“湖的传说”!P
DP90.放学后是幽灵时间!？P
DP91.最后的大胜负！神奇宝贝铁人三项！！P
DP92.回归原点的火箭队!?
DP93.舞动的道馆训练家！梅丽莎登场！W
DP94.帕奇利兹发烧了!两人来看家!?
DP95.神奇宝贝华丽大赛神和大会！（小光得到缎带）
DP96.银河队来袭！！（前篇）G/N
DP97.银河队来袭！！（后篇）G/N
DP98.漂浮的未知怪物！？
DP99.四天王阿柳！相会与离别的森林!
DP100.草苗龟、树林龟…然后是土台龟!（小智的草苗龟进化成树林龟）Z/N
DP101.劲敌训练家·阿驯登场！！C
DP102.缘之道馆赛！VS梅丽莎！！（小智得到遗迹徽章，武藏得到缎带）C
钢系道馆
DP103.混战混乱的水脉市C
DP104.克雷色利亚对抗达克莱伊!（小光的小山猪进化成长毛猪）
DP105.羊羹与洛托姆!
DP106.和神奇宝贝感情融洽的方法!?（小智的天蝎王学会炎牙，小光的长毛猪学会原始之力并进化成象牙猪）S/j
DP107.战槌龙对抗护城龙！！
DP108.水脉道馆赛！钢系对战！！（小智得到矿井徽章）
冰系道馆
DP109.迷路的吼吼鲸！
DP110.亚玄与路卡利欧！C/G
DP111.钢铁岛的遗迹！（小次郎的尖牙笼学会藤鞭）C/G
DP112.皮卡丘与波加曼漂流记！
DP113.爱恶作剧的霏欧纳
DP114.神奇宝贝华丽大赛木通大会!（乌拉拉登场，小光得到缎带，帕奇利兹学会愤怒之牙）L
DP115.狂野君莎与搭档聒噪鸟！
DP116.暴风雪中的雪妖女!
DP117.火箭队解散!?
DP118.神奇圆环!天空大决战!!（小智的姆克鸟进化成姆克鹰并学会近身打）Z
DP119.激烈冲突!象牙猪对抗波士可多拉!
DP120.教学!神奇的口袋中的宝贝!!Z
DP121.怕寂寞的雪笠怪!!（小智的树林龟学会攀登岩石）
DP122.进化!这时波加曼会如何!?C/j
DP123.神奇宝贝华丽大赛立浪大会!!C/j
DP124.神奇宝贝乒乓球大会！双尾怪手加油!!（小光的双尾怪手离队）C
DP125.樱花宝！让人心疼的对战!?
DP126.训练家培育学校的小菘老师！W
DP127.切锋道馆赛!冰之对战!!（小智得到冰河徽章）W
银河队
DP128.对战金字塔！真司对抗神代！Z/s/W
DP129.复活的雷吉奇卡斯！J再度登场！J
DP130.电龙列车!帅哥登场!!（小刚的胡说树学会臂力拳）
DP131.全面对战!真司对小智!!前篇Z/s
DP132.全面对战!真司对小智!!后篇（小智的小火焰猴进化成猛火猴并学会音速拳）Z/s
DP133.由克希的影子!（小刚看到由克希）
DP134.森林王者!巨蔓藤!!（小光的象牙猪学会催醒）
DP135.全员参战!神奇宝贝大胜利!!
DP136.天冠山遗迹!银河队的阴谋!G
DP137.玛力露·波加曼·电击怪!
DP138.小光对抗妈妈!亲子对决!!
DP139.救出大木博士!牛蛙君VS不良蛙!!
DP140.天然雀，天然鸟…不可思议的森林！C
DP141.对战大君！那名男子名叫桄榔!!C
DP142.史上最邪恶的波克比!
DP143.城都特展!菊草叶与小锯鳄登场（小光得到蛋并孵化成火球鼠）
DP144.攻破地窖!?山谷间的发电厂
DP145.收服到……圆陆鲨了
DP146.神奇宝贝华丽大赛睡莲大会！（武藏得到缎带）
DP147.小智与小光！双打对战！
DP148.梦妖与黑暗鸦与暗之石！
DP149.皮卡丘波加曼别黏在一起！！
DP150.红锁链！银河队展开行动!!G/J/N/M
DP151.亚克诺姆·由克希·艾姆利多！G/J/N/M
DP152.帝牙卢卡与帕路奇犽，最后的战斗！G/N/M
华丽大型庆典&电气系道馆
DP153.充满危险！小次郎的宝箱!
DP154.空中对战大师登场！天蝎王对抗巨钳螳螂!（小智的天蝎王学会超级冲击并离队）
DP155.双人对战象牙猪与火球鼠!Z/W
DP156.圆陆鲨与天龙流星!
DP157.收服到圆陆鲨了!!（小智收服到圆陆鲨）C
DP158.失控！自爆磁怪VS巨金怪!!
DP159.怒吼吧急冻拳！泳气鼬对吸盘魔偶!!（小智的泳气鼬学会急冻拳）
DP160.燃烧吧卡比兽!神奇宝贝全能竞技赛的王者!!
DP161.开幕！神奇宝贝华丽大赛！浅葱大会!!W/j/L
DP162.双打比赛!VS正电拍拍&负电拍拍!!（小光得到缎带）L
DP163.爆发进化!烈焰猴!!（小智的猛火猴进化成烈焰猴）Z/C
DP164.波加曼走散了!（小光的波加曼学会水炮）
DP165.四天王大叶与道馆训练家电次Z
DP166.前进!湖滨塔!（小智的树林龟进化成土台龟并学会叶暴风）
DP167.海边的神奇宝贝学校!（武藏得到缎带）
DP168.飞翔吧洁咪！朝向天空的彼岸!
DP169.神奇宝贝保育家！席多蓝恩救援作战！B
DP170.四天王菊野!河马兽VS土台龟!!
DP171.波克基斯飞舞！公主殿下的神奇宝贝华丽大赛!（武藏获赠缎带，小光得到波克基斯）
DP172.波克基斯!华丽的对战!!
DP173.百变怪·变身对战！本尊是哪边咧!?
DP174.华丽大型庆典开幕!炎与冰的艺术!!W/j/L/S
DP175.象牙猪、帕奇利兹!获胜吧“冰灿水晶灯”!!W/L/S
DP176.半决赛!进入决胜的是谁!?(武藏获得第四名）W/S
DP177.最终劲敌对决!小光对抗小望!!（小光获得立志湖华丽大型庆典亚军）W/j/L/S
DP178.再见了火箭队!喵喵的恋爱!?
DP179.电击对战!最后的徽章!（小智得到灯塔徽章，烈焰猴掌握特性“猛火”）
DP180.小智对健悟!各自的起步!!j
DP181.寻宝者麦可与天秤偶!
铃兰大会
DP182.激战前夜!小智的神奇宝贝大集合!!（小智的火球鼠，卡比兽，小锯鳄，龙虾小兵，月桂叶，冰鬼护，煤炭龟，猫头夜鹰，臭臭泥，顿甲，赫拉克罗斯，蜥蜴王，大王燕归队，小智的火球鼠进化成火岩鼠并学会喷火）C/S/Z/P/N
DP183.开幕!神奥联盟!铃兰大会!! C/S/Z/P/N
DP184.神奥联盟第三轮!真司VS阿驯!!C/Z/P/N
DP185.恐怖的骗术空间!小智对考平!!（小智的烈焰猴学会爆炎电击，天蝎王归队并已学会尖石攻击）C/Z/P/N
DP186.宿敌决战！小智对真司!!C/Z/N/s
DP187.白热化的全面对战！小智对真司!!C/Z/N/s
DP188.终结的宿敌对战！小智对真司!!（小智的天蝎王本集结束后离队）C/Z/N/s
DP189.神奥联盟准决赛!达克莱伊登场!!（小智止步铃兰大会4强）C/Z/N
尾声
DP190.神奇宝贝医生小刚!（小刚的好运蛋进化成吉利蛋并学会生蛋）
DP191.回忆是珍珠！友情是钻石!!（小刚、小光离队）N/J/G
特别篇
SP01：小光崭新的出发！！（小光的火球鼠进化成火岩鼠并学会喷火）
SP02：尼比道馆史上最大的危机！
