PE是一个Windows子系统，是一个软件，ISO是一种文件后续，是复制光盘上全部信息而形成的镜像文件。它俩的主要动区别是PE是一种类似操作系统的软件，而ISO只是一种文件格式。具体来说。
WindowsPreinstallationEnvironment（WindowsPE），Windows预安装环境，是带有有限服务的最小Win32子系统，基于以保护模式运行的WindowsXPProfessional及以上内核。它包括运行Windows安装程序及脚本、连接网络共享、自动化基本过程以及执行硬件验证所需的最小功能。
ISO镜像文件符合ISO9660对CDFS格式文件系统或ISO/IEC13346对UDF格式文件系统的定义。
