皮卡丘是一个有“性别差异”的精灵。雌性皮卡丘和雄性皮卡丘有明显的区别，主要在尾巴的形状上。
“性别差异”是源于四代正面游戏《珍珠／钻石》的差异。同种精灵不同性别会有不同的外貌，具体到皮卡丘，就是尾巴形状。Lotom的插画曾经强调过尾巴是心形的雌性，尾巴是方形的雄性。
所以小智的皮卡丘和用于宣传的官方皮卡丘形象都是男性。因为小智的皮卡丘尾巴是正方形的。“性别差异”的概念直到四代游戏才体现在精灵的出现上。而《小智》中皮卡丘的男性则设定在第一代动画中。
在故事中当小智为最后一枚徽章发起攻击时，小智和皮卡丘是灵魂伴侣，激动不已（虽然小霞一直在说冷嘲热讽的话），而小智和皮卡丘的友谊则被定义为“男人之间的友谊”。可见皮卡丘至少在无印初期一直被设定为“少年”。
动画之后不断强调这是一个令人着迷的“可爱男孩”，也正因为如此，皮卡丘因为各种“争风吃醋”的事情而卷入战斗。
在阿罗拉地区的皮卡丘谷，“新来的”皮卡丘很快引起了一只雌性皮卡丘的注意，并很快产生了好感，注意到了它们尾巴上的差异。很快他们就开始“牵着尾巴”，这是皮卡丘特有的交流方式。皮卡丘主要是用尾巴感知周围的变化。
情况是小智的皮卡丘“俘获”了女皮卡丘的“心”。不过这很快就给小智里的皮卡丘带来了一些麻烦，很快又有一个“男”皮卡丘（注意尾巴）过来“招惹”。任何生物都会为求偶而战，这是必然的。
很快就有了“战斗”可见小智里的皮卡丘和官方宣传用的皮卡丘都是男性，在皮卡丘里都是相当有攻击性的“帅哥”。作为皮卡丘族群中的“帅哥”，被吸引的女宝可梦当然远不止一个女皮卡丘，其他很多女宝可梦都是“一见钟情”。
皮卡丘的角色形象
皮卡丘是一只电气鼠，它全身的皮毛都是黄色的，背上有两条褐色的条纹，尾巴是像锯齿状的闪电，与身体相接的部分也有一片褐色的皮毛。它有着小小的嘴巴以及黑色的眼睛，脸颊上有着红色的电力袋，长长的耳朵尖端是黑色的。
它的前爪短而粗，有五趾，后爪则只有三趾。而越是能制造出强大电流的皮卡丘，脸颊上的囊就越柔软，同时也越有伸展性。
由于它脸颊上的袋子中储存了电能，人们触摸了之后会觉得麻麻的。它跑动的时候是用四条腿着地快速地奔跑，但是更多时候它是站立着的并用两只后脚走路。
