选D(三个碱基决定一个氨基酸，插入一个，就会彻底改变碱基的读码顺序)
分析：
A.置换碱基对，读码顺序依然是完全错误的。
B.增加4个碱基对，总共就是增加5个碱基对，读码顺序依然完全错误。
C.缺失3个碱基对，总共就是缺失2个碱基对，读码顺序依然完全错误。
D.缺失4个碱基对，总共就是缺失3个碱基对，这样合成的肽链只会少了一个氨基酸，其余的氨基酸都是完全正确的，影响最小。（蛋白质结构是由氨基酸序列所决定的）
知识点：三个连续的碱基就是一个密码子，决定一个氨基酸。一旦缺失或者增加（非3的整数倍）个碱基对，顺序就会彻底改变，编码的蛋白质就面目全非了。
