阿尔宙斯抓到的精灵在精灵图鉴内可以看，也可以在玩家的宝可梦背包中看。但是玩家的宝可梦携带数量有限，最多10只宝可梦，如果超过10只后玩家抓获的宝可梦就只能在精灵图鉴里看了。
玩家除了直接投掷精灵球抓宝可梦外，对战也是捕捉宝可梦的重要手段。玩家通过对战削减宝可梦的体力，会让捕捉变得更容易。特别是遇到好战的宝可梦时，如果它发现了主角就会主动攻过来，十分危险。
捕捉野生宝可梦
野生宝可梦的行动会依种类而有所不同。针对宝可梦的特征找到最适合的捕捉方式，是影响捕获成功与否的关键。
玩家可通过投掷精灵球来捕捉野生宝可梦，当发现想要捕捉的宝可梦时，玩家要先设法接近它，并准备好投掷精灵球，然后好好瞄准宝可梦，抓住时机丢中宝可梦。
进入精灵球内的宝可梦只要不再跑出来，就表示捕获成功。而在遇到立刻就会逃跑的宝可梦时，玩家只要在草丛或岩石躲起来，就不容易被宝可梦发现。
