通关后大木博士会看你抓的精灵种类，如果种类达到60只以上的话，会给你去1，2，3号岛的船票。如果不足60种的话，也没关系。只要抓住60种精灵，就回研究所，和大木博士对话，也能得到船票。
图鉴收集到60个以后，去找博士，就可以开启新的剧情了。
到库吉市码头坐船去1岛，首先再去找精灵中心大机器下的那个人吧，得知需要宝石。再去灯火山一次，入口往右走，2个火箭队员在讨论什么，听到1个暗号，在第2个暗号说出来前，2个人沉默了，冲上去K他们。
进洞找红宝石，拿到红宝石后回到精灵中心那个人那里，一段废话后，得到七子岛的船票，去6岛，往下走有一个洞穴是封住的，用居合斩把门打开，到最底层得到蓝宝石，交给1岛精灵中心的男子。
完事了去4岛逛逛先，看到对手，奇迹啊，他居然没有找我虐他，4号岛有一间屋子是冰天王的家，家里没人，去右边山洞救出冰天王。打完后看到火箭队说了5岛仓库，好了，目的明确，去5岛。
来到岛5，纵观岛5城镇地毯式搜索，从左往右，从上到下，先去左边吧(水之迷路)，一个小岛，一个挑战者，还有一个老爷爷(拿蛋)。
下一个目的地是高石神秘地，就是从水之迷路往上走，这里有很多有画画狗的训练家，有个洞穴,进去看看。
不归洞走法：
1、右下(得到气物:敌人命中下降一阶,果然翁带着生蛋可以生出小果然)
2、右上下上(得到潮物:水系威力上升为原来的1.05倍,母的马利露和马利露利带着生蛋可以生出露莉莉)
3、右上下下右右(得到精神草:濒死全恢复)
4、右上下下右左下左(得到奇异甜食:升一级)
5、右上下下右左下右上(遇到阿吉木,与之交战:两个49猫老大,注意,打完后离开那里再去一次可以得到西库头巾，普通招威力*1.1)
扩展资料：
口袋妖怪四大天王的剧情：
4.5版本的话是主角先去橙华森林里面的森之洋馆，进右上方的楼梯来到2层，在里面会看到小光，发现小光的意识被控制了，与小光对战胜利后回到一层，走左上方的楼梯，在里面可以获得月食之羽。当上冠军之后就需要让主角梦醒了。
以下是让主角梦醒的过程：
先去水静市上方的魅影摩天楼找米可利，然后去秘密基地里和小智小茂、希罗娜、阿迪克和艾莉丝对话。3.对战完之后会有一段剧情，剧情结束主角会梦醒。
事件：进入橙华之森的，上楼遇到被控制的，击败后底楼左侧的楼梯开启，上楼后取得月食之羽并与对战，完成后前往水静市NPC房间内睡觉进入噩梦，托付主角平定时空两神的战斗，为测试主角实力展开对战。
事件：通关后水静市旅馆二楼女子处得到三日月之羽后前往古辰镇某NPC房间里睡觉进入新月岛，捕获。
