日本的矿产资源贫乏，虽然其矿产资源种类较齐全，但蕴藏量都很小，因而有人称之为“金属资源标本国”。其主要原因是日本的地面将近2/3为新生界及新期火成岩之喷出岩，地质构造运动激烈且断层多，导致矿床小、矿层薄、矿石杂质含量高。在日本的矿藏中，煤、石灰石、硫磺以及铜、铋等的蕴藏量相对较大。煤主要分布在北海道和九州。日本煤炭蕴藏量约为86亿吨，已探明的可开采储量仅为10亿吨，这当中有2/3靠近海域，水份和瓦斯含量高，开采费用高。由于能源革命（从煤转向石油等），日本的煤炭生产不断萎缩，1990年日本约采煤800万吨，是1970年的1/5，仅占当年消费量的7.1%。在金属矿中铜的蕴藏量和开采量都居前列。铜矿区达2000余个，以本州岛的枥木、岩手、秋田、茨城等县为主要产地。硫磺主要产自本州和北海道地区
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