萧平章于战场毒发身亡。萧平旌在荀白水和萧元启的诡计之下落得个抗旨的罪名。萧庭生逝世。之后长林府被封府，而长林军编制也被撤掉了。再后来隐居多年的萧平旌，在萧元启和敌国制造的危难中起兵勤王。最后萧平旌再次离开金陵归隐。
《琅琊榜之风起长林》讲述的是《琅琊榜》之后的故事。故事以当年受教于梅长苏并被萧景琰收养的萧庭生为人物线索进行延展。在《风起长林》这个故事中，一代长林军主帅萧庭生的膝下共育有二子，一个是长子也是义子的萧平章，还有一个是次子萧平旌。萧平章是长林军中的副帅，率军守护着大梁边境与长林王府上下的周全。而萧平旌则师承琅琊阁，之后于家门变故中逆境成长。萧家三父子始终以守家卫国为大任，共同谱写着忠义风骨。
夜秦人濮阳缨为报灭国之仇，不仅在北境交战中断掉前线补给，致使萧平章身受重伤，之后更是在京城制造大规模的疫情。而萧平章与萧平旌在追查过程中先后中毒。与此同时北境战事急危，于是萧平章便放弃救治而奔赴前线支援，最后不幸毒发而亡。萧平旌为保国境安宁，在长兄萧平章牺牲后即刻驻守边疆。
梁帝萧歆死后，荀白水与萧元启用诡计对抗长林王府。萧平旌为了百姓，反而落得个抗旨的罪名。而后萧庭生逝世，整个长林府被封，长林军的编制也被撤。萧元启卖国谋逆，致使国家安危告急。此时隐居多年的萧平旌于危急之中起兵勤王。待大梁安危解决之后，萧平旌再次离开金陵，最终选择归隐了。
