“柯南标志图”：能代表柯南这一经典形象的标志图案
在漫画连载至第5、6话左右时，编辑部提出了动画化的意向。在漫画原著受到欢迎后，读卖电视台制片人诹访道彦看到了商机。在持续看了10周漫画后，诹访道彦决定做一部改编动画片。1995年2月至3月左右，制片人确定《名侦探柯南》成为《魔法骑士》的接档动画片。因为第1集柯南几乎没有出场，所以《名侦探柯南》是先从第2集开始制作的。
因为漫画开始连载没有经过多久就播出了动画片，为了不追上原著进度，该片从一开始就加入了原创剧情。最初的原创剧集——第6集《情人节杀人事件》（1996年2月12日播出）中青山刚昌对剧本进行了详细的检查，后续的原创剧集则交给了动画制作团队。
第96集《走投无路的名侦探连续两大杀人事件》是最先开始进行数字制作的剧集。2001年1月8日播出的2小时特别篇《名侦探齐聚一堂！工藤新一VS怪盗基德》已经采用了全片数字制作的形式。同时从该集起，作品使用3D的门作为过场画面。
2007年1月15日播出的《1年B班大作战！》起，作品的音乐进行了整体的更新。
2014年播出的第742集和2018年7月14日播出的第907集是与日本职业足球联赛联动的剧集。
2016年4月16日播出的剧集《悄悄逼近安室的黑影》是电影《名侦探柯南：纯黑的噩梦》外传性质的剧集。
2017年4月15日播出的剧集《消失的黑带之谜》是《名侦探柯南：唐红的恋歌》的前传。
2018年4月7日播出的剧集《蛋糕融化了！》是《名侦探柯南：零的执行人》的前传。
2019年4月13日播出的剧集《美食广场的阴谋》是《名侦探柯南：绀青之拳》的外传。同年诹访道彦被调往ytvNextry，作品的署名字幕随之于6月1日作出变更。8月10日，播出与电视剧《轮到你了-反击篇-》合作的剧集《广播电台的烦恼咨询（解谜篇）》。
2019年9月21日，片方宣布《名侦探柯南》在2020年1月连续4周播出特别篇《大怪兽哥美拉对战假面超人》，并发布先行视觉图，同年11月27日，作品发布《大怪兽哥美拉对战假面超人》的主视觉图。12月25日，片方宣布搞笑组合“巧克力星球”担任特别篇客串配音。
2020年12月16日，片方公布针对播出1000回的企划“猜猜看重启（Reboot）的神回！”及其视觉图，宣布以新制作阵容和技术重制《名侦探柯南》中被称作“传说中的神回”的剧集，对应剧集的剧照包含在视觉图的背景图片中。2021年1月8日至3月5日，作为播出1000回纪念企划第2部分“最佳片头片尾曲”中的内容，动画片《名侦探柯南》官方YouTube频道期间限定发布历代片头片尾影像。
