你好我是一位柯南迷，很高兴回答您的问题，柯南中主线剧集除了第一集云霄飞车杀人事件外还有：
048外交官杀人事件(前篇)
049外交官杀人事件(后篇)
057夏洛克•福尔摩斯˙诡异的杀人事件(前篇)
058夏洛克•福尔摩斯˙诡异的杀人事件(后篇)
128黑暗组织10亿抢劫事件
129来自黑衣组织的女子大学教授杀人事件★
162飞天密室工藤新一最初的事件★
176与黑暗组织的再会(灰原篇)
177与黑暗组织的再会(柯南篇)
178与黑暗组织的再会(解决篇)
188危命的复活洞窟内的侦探团
189危命的复活负伤之下的名侦探
190危命的复活第三个选择
191危命的复活黑衣骑士
192危命的复活新一回来了
193危命的复活约定的场所
230谜一样的乘客(前篇)
231谜一样的乘客(后篇)
238大阪3K事件(前篇)
239大阪3K事件(后篇)
246缠在网子中的谜团(前篇)
247缠在网子中的谜团(后篇)
258来自芝加哥的男子(前篇)
259来自芝加哥的男子(后篇)
284中华街雨中的似曾相识(前篇)
285中华街雨中的似曾相识(后篇)
286工藤新一纽约事件(事件篇)
287工藤新一纽约事件(推理篇)
288工藤新一纽约事件(解决篇)
307无声的证据（前篇）
308无声的证据（后篇）
309与黑暗组织的接触（交涉篇）
310与黑暗组织的接触（追踪篇）
311与黑暗组织的接触（决死篇）
329金钱买不到的友情(前篇)
330金钱买不到的友情(后篇)
335东京现影所的秘密(前篇)
336东京现影所的秘密(后篇)
338四辆保时捷(前篇)
339四辆保时捷(后篇)
340厕所里隐藏的秘密(前篇)
341厕所里隐藏的秘密(后篇)
345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重谜案★
400持有疑惑的小兰
421银杏色的初恋(前篇)
422银杏色的初恋(后篇)
425黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间★
426给兰的情书
445俄罗斯蓝猫的秘密
460一年B班大作战
462黑暗组织的影子年幼的目击者
463黑暗组织的影子奇妙的照明
464黑暗组织的影子谜样的高额报酬
465黑暗组织的影子珍珠的流星
466坚不可摧的雪人(前篇)
467坚不可摧的雪人(后篇)
472工藤新一少年的冒险(前篇)
473工藤新一少年的冒险(后篇)
490服部平次vs工藤新一滑雪场的推理对决★
491红与黑的碰撞开端
492红与黑的碰撞血缘
493红与黑的碰撞绝叫
494红与黑的碰撞冥土
495红与黑的碰撞昏睡
496红与黑的碰撞侵入
497红与黑的碰撞觉醒
498红与黑的碰撞搅乱
499红与黑的碰撞伪装
500红与黑的碰撞遗言
501红与黑的碰撞嫌疑
502红与黑的碰撞洁白
503红与黑的碰撞决死
504红与黑的碰撞殉职
507卡拉OK包房的死角（前篇)
508卡拉OK包房的死角（后篇）
511推理对决！新一VS冲矢昴
515怪盗KID的瞬间移动魔术★
521杀人犯、工藤新一★
522新一的真面目与兰的眼泪★
523真正想问的事
542让鱼儿消失的一角岩（前篇)
543让鱼儿消失的一角岩（后篇)
545雾中尖叫的魔女(前篇)
546雾中尖叫的魔女(后篇)
557与危险的二人同行
558死亡之馆赤壁(三顾之礼)
559死亡之馆赤壁(掌中物)
560死亡之馆赤壁(孔明之死)
561死亡之馆赤壁(空城计)
563侦探团VS强盗团（骚乱）
564侦探团VS强盗团（沉默）
568白鸟警部樱花的回忆（前篇)
569白鸟警部樱花的回忆（后篇）
571妖怪仓库中的夺宝战斗（前篇）
572妖怪仓库中的夺宝战斗（后篇）
573难为情的护身符的去向（前篇）
574难为情的护身符的去向（后篇）
578召唤危机的红色凶兆
579黑与13的暗示
580逼近黑色时刻
581红色的摇摆目标
二
有的是组织的，有的是基德，都很精彩
307无声的证据（前篇）
308无声的证据（后篇）
309与黑暗组织的接触（交涉篇）
310与黑暗组织的接触（追踪篇）
311与黑暗组织的接触（决死篇）
329金钱买不到的友情(前篇)
330金钱买不到的友情(后篇)
335东京现影所的秘密(前篇)
336东京现影所的秘密(后篇)
338四辆保时捷(前篇)
339四辆保时捷(后篇)
340厕所里隐藏的秘密(前篇)
341厕所里隐藏的秘密(后篇)
345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重谜案★
400持有疑惑的小兰
421银杏色的初恋(前篇)
422银杏色的初恋(后篇)
425黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间★
426给兰的情书
445俄罗斯蓝猫的秘密
460一年B班大作战
462黑暗组织的影子年幼的目击者
463黑暗组织的影子奇妙的照明
464黑暗组织的影子谜样的高额报酬
465黑暗组织的影子珍珠的流星
466坚不可摧的雪人(前篇)
467坚不可摧的雪人(后篇)
472工藤新一少年的冒险(前篇)
473工藤新一少年的冒险(后篇)
490服部平次vs工藤新一滑雪场的推理对决★
491红与黑的碰撞开端
492红与黑的碰撞血缘
493红与黑的碰撞绝叫
494红与黑的碰撞冥土
495红与黑的碰撞昏睡
496红与黑的碰撞侵入
497红与黑的碰撞觉醒
498红与黑的碰撞搅乱
499红与黑的碰撞伪装
500红与黑的碰撞遗言
501红与黑的碰撞嫌疑
502红与黑的碰撞洁白
503红与黑的碰撞决死
504红与黑的碰撞殉职
507卡拉OK包房的死角（前篇)
508卡拉OK包房的死角（后篇）
511推理对决！新一VS冲矢昴
515怪盗KID的瞬间移动魔术★
521杀人犯、工藤新一★
522新一的真面目与兰的眼泪★
523真正想问的事
542让鱼儿消失的一角岩（前篇)
543让鱼儿消失的一角岩（后篇)
545雾中尖叫的魔女(前篇)
546雾中尖叫的魔女(后篇)
557与危险的二人同行
558死亡之馆赤壁(三顾之礼)
559死亡之馆赤壁(掌中物)
560死亡之馆赤壁(孔明之死)
561死亡之馆赤壁(空城计)
563侦探团VS强盗团（骚乱）
564侦探团VS强盗团（沉默）
568白鸟警部樱花的回忆（前篇)
569白鸟警部樱花的回忆（后篇）
571妖怪仓库中的夺宝战斗（前篇）
572妖怪仓库中的夺宝战斗（后篇）
573难为情的护身符的去向（前篇）
574难为情的护身符的去向（后篇）
578召唤危机的红色凶兆
579黑与13的暗示
580逼近黑色时刻
581红色的摇摆目标回答者：离开的纠纷|二级|2011-6-1211:35
304：震动的警视厅1200万名人质
491—504：红与黑的碰撞吧，有关于FBI的；
356：怪盗基德的惊异空中漫步，
515：怪盗基德的瞬间移动魔术:；
537‘538：怪盗基德VS最强金库；
345：与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案；
425：黑色的冲击！黑衣组织魔爪伸来的瞬间；
还有一个特别篇，鲁邦三世VS名侦探柯南，很精彩的。。。。
三
服部平次走投无路（TV323~324）
总局刑警恋爱物语5（TV358~359）
总局刑警恋爱物语6（TV390~391）
总局刑警恋爱物语7（TV431~432）
总局刑警恋爱物语虚假的婚礼（TV449）
总局刑警恋爱物语8左手的无名指（TV487）
银杏色的初恋（TV421~422）博士的爱情哦
便利店的陷阱（TV343~344）朱蒂啊~
与黑衣组织一决胜负满月之夜的双重推理（TV345）必看，该有的都有了！！！！
黑色冲击组织的魔爪逼近的瞬间（TV425）历久弥新
怪盗基德与四幅名画（TV469~470）
红与黑（所有集数都好）组织大揭秘，秀一怜乃大碰撞，超长，过瘾，
红白黄色与侦探团（TV509）疑似bourbon的首次出现
怪盗基德的瞬间移动魔术（TV515）
推理对决新一VS冲矢昴（TV510~511）
杀人犯工藤新一（TV521~522）
怪盗基德VS最强金库（TV537~538）
赤井秀一再现（TV578~581）真真假假，假假真真
福尔摩斯的默示录（伦敦篇）（TV616
里面有组织的，也有基德的，不过对不起时间紧没有整理哦，你可以自己整理一下！
