把清洗后的化石放在化石机里面，然后放一颗捕捉宝可梦的球在那里，等待复活完成之后就可以取回球了，里面就装着化石机复活好的宝可梦。
化石是生活在遥远的过去的宝可梦的遗体或遗骨变成的有机素体，例如骨架、龟壳等等。
在宝可梦的世界，关都地区红莲镇的红莲研究所和丰缘地区得文公司的研究小组在同一时间研制出了能使古代宝可梦的化石复活的机器。在其它地区通过化石研究者也能让化石复活。想要复活古代宝可梦就必须得到它的化石，通过化石复活机，从化石里提取出宝可梦的基因，并将它重新组合成宝可梦。复活的宝可梦和之前的模样并不完全相同，并且没有过去的记忆。
除了在第八世代组合两种碎片而合成的化石外，通过化石复活的宝可梦一般都拥有岩石属性，这也证实了复活的宝可梦和古时候的本体不完全相同，而长时间封存在岩石中已经某种程度上改变了基因。
在第四世代之前，化石属于重要物品，只能获得一个；第四至第七世代，化石转变一般道具，可以重复获得，并且可以出售和投掷；在第八世代，化石变为宝物。
在主系列游戏中，除了第二世代和第七世代，每个世代都会有新发现的化石。
因为是从化石中复活的原因，大部分的化石宝可梦的属性都包含了岩石属性（除第八世代），这类宝可梦没有野生宝可梦（除第八世代），也很少有宝可梦训练家拥有。
