在故事发生的时间上,《冒险岛2》所讲述的故事比《冒险岛》中三个神创造世界及黑魔法师降临的故事更为古老。
在冒险岛的世界里,存在着三个拉潘塔——生命之绿色拉潘塔,时间之红色拉潘塔,空间之蓝色拉潘塔,它们是这个世界的根源力量,维持着世界的平衡。
在拉潘塔还未诞生之前,世界的平衡由三位德高望重的贤者维持。但是拥有黑暗力量的魔王出现了,世界陷入了平衡被破坏的危机之中。女皇艾瑞芙、贤者以及众多的勇士随即进行反抗,但魔王太过强大,他们始终不能完全抵抗。最终三位贤者不惜牺牲自己的生命来凝聚力量,制作出三个拉潘塔,最终将黑暗力量封印于暗影世界里。女皇任命并肩作战的勇士们为新的贤者,并嘱咐他们保护拉潘塔的安全,世界又恢复了和平。
但是某一日,空间之蓝色拉潘塔却遭到破坏,冒险岛世界各处发生了气象异变,封印着黑暗力量的时空门的力量逐渐虚弱,世界再次面临危机。新的勇士们战斗即将打响!
(注:虽然官方将《冒险岛2》的故事发生时间放在《冒险岛》之前,但二者不是承前启后的关系,而是《冒险岛2》延续了“玩家扮演英雄,共同对抗黑暗势力”这一传统。)