第一部系列剧场版：
1998年：剧场版01－超梦的逆袭
1999年：剧场版02－洛奇亚的爆诞
2000年：剧场版03－结晶塔的帝王
2001年：剧场版04－雪拉比的穿越时空遭遇
2002年：剧场版05－水都的守护神
超世代系列剧场版：
2003年：剧场版06－七夜的许愿星
2004年：剧场版07－裂空的访问者
2005年：剧场版08－梦幻与波导的勇者
2006年：剧场版09－沧海的王子
钻石&珍珠系列剧场版：
2007年：剧场版10－决战时空之塔
2008年：剧场版11－冰空的花束
2009年：剧场版12—超克的时空
2010年：剧场版13—幻影的霸者索罗亚克
超级愿望系列剧场版：
2011年：
【放送局】
主要讲述的是和小智分别的主要角色，或者配角特别经历的番外故事。剧情发展和后续的TV动画都有一些关系。
01－小刚,拯救尼比道馆
02－华蓝道馆复仇之战
03－加油，积极向上的火箭队
04－大木研究所大决战
05－相会千年镇，喵喵辛苦打工记
06－小霞得到蓝色徽章吧
07－神秘侦探喵喵登场，小侄女露力丽是大麻烦
08－神奇宝贝搜查网去寻找大木博士吧
09－小霞，认真对决赌上性命
10－雪拉比的另一个传说
11－火箭队，爱与青春的原点
12－真新镇，神奇宝贝训练家的旅程
13－神奇宝贝研究者小茂与复活的化石翼龙
14－小霞与爱心鱼，爱的战斗
15－奈奈与喷火龙，火焰的猛烈特训
16－穿梭天际的传说，阿弘与火焰鸟
【特别篇】
1、超梦，我就在这里
2、雷公,雷之传说
3、幻影神奇宝贝的战栗
4、不可思议的迷宫救难队
5、不可思议的迷宫救难队暗之探险队
6、不可思议的迷宫时空探险队
【ANA短篇】
1、皮卡丘的暑假皮卡丘的圣诞节皮卡丘的寒假玩雪去皮卡丘的寒假圣诞夜
2、皮卡丘的探险队
3、皮卡丘与皮丘
4、皮卡丘心跳捉迷藏
5、皮卡皮卡的星空露营
6、皮卡丘的跳舞秘密基地
7、皮卡丘的夏日祭典
8、皮卡丘的鬼怪狂欢节
9、皮卡丘的顽皮岛
10、皮卡丘的探险俱乐部
11、皮卡丘冰之大冒险
12、皮卡丘闪亮大搜索
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