在大地初现之际，天界中的巴鲁垛司神与欧库托姆神爆发了一场纷争。大地映照了天界的水境，但人们对纷争的原因一无所知。随后地上的动乱之火燃起，太古的因缘与散落在天地之间的巴鲁垛司御魂至今仍延续着生命。祈祷时刻到来，亚宾与艾依梅这对孤儿被收养在卡特多拉鲁的神殿中，欧蕾西亚对他们感情甚好的兄妹感到欣慰。但是风云突变，曾被驱逐出卡特多鲁的贝里亚司突然出现在神殿外，僧兵难以抵挡其强力的攻击和魔法。最高导师将卡贝沙交给亚宾，库耶鲁交给艾依梅，这两个宝物是卡特多拉鲁历代所传的神宝，在风平浪尽之前就由他们保管。为了保护两个孩子，艾司裴利决定留下来拖住贝里亚司。贝里亚司借助欧库托姆的势力来占领卡特多鲁。这场战争源于太古时代的诸神纷争。
逃出来的人都住在葛维的朋友狄那凯所住的普列亚务特。由于欧库托姆的信徒追查，亚宾和艾依梅被分开隐藏，彼此失去了联系。亚宾被带到雷幕拉斯贤者家中，艾依梅的去向不明。亚宾在雷幕拉斯家中得到麦依的帮助，两人得到雷幕拉斯的真传。雷幕拉斯临终前告诉亚宾艾依梅的藏身之处，只有住在奇布里村的狄那凯知道。亚宾悲伤过后，准备离开观景小屋去找妹妹艾依梅，在屋中找到配带的短箭。
亚宾来到乌鲁特村，向村长辞行，并得到格格布的地图。亚宾本想独自闯荡，但麦依的强行加入改变了他的想法。他们购买帐篷来存储游戏进度。亚宾来到非尔汀城，救下被怪物包围的少女雪侬，她名叫雪侬，是奇布里村的人。为了答谢亚宾和麦依的救命之恩，雪侬邀请他们去她家做客。
来到狄那凯老者的家中，狄那凯不愿意见任何人。亚宾等人被罗蒂丝叫住，罗蒂丝告诉亚宾狄那凯的助手罗蒂丝想见他。罗蒂丝让亚宾等人从书房的暗门出去，找到巴斯达，他会带亚宾去见狄那凯。在巴斯达的带领下见到狄那凯，此时巴斯达的狐狸尾巴也露了出来。原来罗蒂丝和巴斯达把狄那凯老者关在洞窟中，试图得知神宝的下落。危险时刻狄那凯的小狗救了众人。由于邪教已经知道神宝的下落，狄那凯无需再保守秘密，让亚宾去找欧雷西亚，她是修道院的院长，关于卡贝沙的事也需听从欧雷西亚的指示。
回到布里奇村，到雪侬家中做客。雪侬的父母热情招待了亚宾和麦依。饱餐一顿后亚宾和麦依告别了雪侬，来到了非尔丁城。他们建议购买一些武器和铠甲，对以后的作战有很大帮助。
西行向伯伦城进发，刚入城门就见一个老头急冲冲地跑来，说镇上出事了，有人劫持女孩，要以亚宾来交换。亚宾听后与麦依急步赶去，原来又是罗蒂丝和巴斯达的鬼计。他们想迫使亚宾交出卡贝沙。在这千钧一发的时刻，罗蒂丝得到报告，一个名叫波鲁特的人已经向修道院进发。为了抢头功罗蒂丝等人只能向修道院赶去。
令人无法想象的是被劫者竟是雪侬。此时她已经吓晕过去了，被好心的思汶婆婆收留下来。亚宾和麦依继续西行。到了新伯伦城，城中有一个名叫达库斯的人，和他签约，他会加入亚宾的队伍。
出新伯伦城西行一段后看见一路标，北方是修道院，西方是甲赖鲁洞窟。向北行走到达了修道院，将贤人狄那凯的介绍函给门卫看，她会放亚宾进去。修道院中一片狼藉，遇见欧蕾西亚院长后得知波鲁特带僧兵已经攻击了修道院，好在欧蕾西亚院长已在昨天让艾依梅以使者的身份带着库耶鲁去海对面的德西斯，那里是最强的世界，是最安全的地方。
但是危险并未过去，院长告诉亚宾唯有追上艾依梅与她一同将两个宝物交到巴鲁库特的贤人手中，才能真正摆脱威胁。一行人又回到了祈伯伦城，刚进城就碰到一个杀气很重的神秘男子，亚宾和麦依“不思其解”。
出北城时遇见了三个正在讨论失踪女孩的姑娘，亚宾接受了她们的求助。出城后向花园之丘方向进发。在途中又见一路标，指出向北入小葡萄森林。进入森林后向西寻找，果然找到了失踪的少女。咦，又是雪侬，原来这个痴情姑娘对麦依一见钟情。在麦依离开之后，她竟不顾路途险恶一直追踪至此。救醒之后将她托给尼雷爷爷照顾。
进入吉亚中西北处的工厂，有一个叫拉布亚的人请亚宾帮着做一些传达情报的事情。在出城后拉布亚突然跑来叫住亚宾，再次请求他们援助。因为邪宗教徒要侵占他们的工厂，启图占有矿石与希土勋章。
来到第五号熔炉，果然波鲁特带着一批僧兵正在威胁工人，他们抓了鲁卡作为人质，并炸毁了五号熔炉。眼看鲁卡就要葬身火海，亚宾将他救出。但万万没想到鲁卡竟是罗蒂丝的弟弟。罗蒂丝对波鲁特非常不满，所以没有对亚宾与麦依发难。
来到迪亚桥遇上一些山贼，要诈取2000洛赛的过桥费。在一片风琴声中，亚宾来到了拔娄亚。本可以追上艾依梅，但没想到中途出了吉西亚那桩事耽搁了赶路，所以只能赶往塞塔港。
到城西港口买船票，上港后突然发现一个熟悉的身影，是艾依梅。刚想追上船去，怎奈这艘船已客满。只能搭下一艘船。由于水流的原因，很快就追上第一艘船。令人难以想象的是第一艘船上不仅有艾依梅，还有雪侬这个痴心的姑娘，口中还喃喃自语着麦依的名字。
这时一艘海盗船冲了上来，抓走了两个姑娘。亚宾与麦依追上第一艘船没能找到艾依梅，又急忙跳上了海盗船。一场恶斗终于消灭了海盗。兄妹俩终于相见了。但船被撞破洞，立刻就要沉了。好在客船及时赶到，一切平安。兄妹分离8年后终于再次重缝。
到了塞塔港口后，亚宾让雪侬与艾依梅到酒馆中等候。走一圈后在城西的酒馆中找到正等着的艾依梅与雪侬。艾依梅说街上停着一辆胡乱放置的兽车，令市民十分困扰。
刚出门就遇见一个叫格里克的与另一个叫夏喀的人正在为这件事而争吵，亚宾与麦依商谅后决定领走这辆车。那俩人欢天喜地的走了。亚宾一行人到了城外一看，是一辆十分漂亮的车，他们想都未想就上了车。
正在他们高兴的时候，远处的罗蒂丝与巴斯达正在密谋如何中途劫取卡贝沙与库耶鲁，想在波特鲁前得手，原来这又是个阴谋。在行车的时候，巴斯达与罗蒂丝架车从后赶上，撞翻了亚宾坐的车。亚宾与麦依等人都晕倒在地，巴斯达乘机夺走了库耶鲁与卡贝沙。
当罗蒂丝在遣责巴斯达狂涨的私欲时，波鲁特出现了。原来巴斯达与波鲁特早已沟通好了。但由于两者意见不合，波鲁特用出了闪电术将巴斯达杀死。而麦依、罗蒂丝为了保护神宝也被击倒在地。当波鲁特想向亚宾兄妹下毒手的时候，有一股神秘的力量挡住了他的闪电击。
一阵旋风将波鲁特卷走。他叫米雪儿是一个旅者。当雪侬醒来时，他又离开了。不知过了多久，亚宾也醒来了，但他只看见倒在地上的罗蒂丝与艾依梅。雪侬与麦依已不见踪影。
不久艾依梅也醒来，俩人正为了无法解救罗蒂斯而苦恼时，突然贤者葛维出现了。几句感慨后葛维送亚宾等人去巴鲁库特。
在车上亚宾思绪万千。到达圣都了亚宾、艾依梅与葛维又谈起了当年往事。随后在葛维的陪同下，亚宾与艾依梅将卡贝沙与库耶鲁交给了最高导师库洛尔。库洛尔回答了关于神宝故事的询问，使亚宾得知另有四件神宝仍散落在世间，只有集结了六件神宝才能彻底摧毁邪教。
当晚亚宾就在圣都住下。他先去看望了罗蒂丝（右边的一间），得知他并无大碍，休息一段时间便可好转。
在神殿中四处转悠，靠右的一个大厅内亚宾遇到了一个叫龙耶的孩子，龙耶向他介绍了厅中的一面非常漂亮的彩绘玻璃。亚宾很想去圣殿看看。
快要出城时有一僧侣赶来叫住了亚宾，告诉他神宝的归还仪式即将举行，要他在自己的房中等候。于是亚宾又回到了自己房间，与艾依梅一起和罗蒂丝闲聊。这时龙耶跑进来，报告说礼拜堂的归还仪式已准备好了。
依式开始了艾依梅与亚宾作为第一大功臣受到了嘉奖。正在这时彩绘玻璃上突然出现了波鲁特的影子。他竟然穿透如此强大的洁界。
在波鲁特威胁最高导师时，伤未全愈的罗蒂丝赶来。由于她的攻击，众人才得以逃脱。但她却被波鲁特击倒。在神殿的另一处有一红发男人入侵，且潜伏在神殿中。他叫马多姆是波鲁特雇来的杀手。
但是在他冷酷的眼中似乎还能找到一丝善良。当他并未加害罗蒂丝而要离开时，被迎面而来的葛维、亚宾、艾依梅拦住。艾依梅认出了马多姆。他就是搭救欧蕾西亚老师的人。
为何会成为波鲁特的杀手？正当艾依梅劝服马多姆，马多姆竟向艾依梅下了毒手。艾依梅倒下时，远处传来了波鲁特的笑声……
艾依梅无法再次睁开眼睛，亚宾在极度悲伤中无力而颤抖地守在尸体旁。几天过后亚宾仍象一具活尸，悲伤仍占据了他的心灵。
这时那个神秘的旅者米雪尔又出现，他是从另一个贤者狄那凯那儿来。得知发生的事情后，他也加入了亚宾的队伍。还告知众人在埃鲁、非尔汀城还残留着巴鲁垛司神与欧库托姆之外的传承体系，被塞塔以北的海岸边的特库斯村庄传承着。
在真实的岛上有一种圣水，可以化解所有咒语。当然这也是解救罗蒂丝的唯一方法。经过米雪儿的一番开导后，亚宾重新振奋起来，答应去真实之岛。
亚宾一行人出了北门，北上塞塔。有米雪尔这样的高手加入旅途会相对轻松许多。到达特库斯之后，要询问至少五个村民，才能去拿神树叶。树林在村的北面，动作要快一些。
因为神树林的落叶会污染环境，所以每天都必须烧掉。亚宾赶到时已经晚了，落叶已在焚烧。正当惋惜的时候，突然发现烧树叶人的头上还留着一片树叶。
经过向村民询问，得知要去真实岛必须借船过海。到村中的港口，借得船后，向真实的岛进发。依靠米雪尔高超的法力，小船乘风破浪来到了真实的岛。
在岛上他们发现了古文明遗迹，并发现了一扇石门。由于石门上的封印魔力太强，连米雪尔也打不开，只能做罢。往下走可发现一个类似地下室的入口。
入洞后先向右再向上走，顺着路在第三个拐弯处有一个非常不易被发现的入口，就象穿墙而过一样。随后就可以取得圣水，制成解药。亚宾与米雪尔径直向前走，看到一副壁画，俩人分析了画的成因。
这时米雪尔感到了一股空间力量，他认为是种叫夏路的装置，可以用影像来表达神的意旨。通过米雪尔的神力，亚宾回到了过去的时光，看着爷爷，看着自己与麦依游玩，又到另一处得知湖神的存在，还去坟场。
看到了四处场所，但不知这有何意义。最后决定回到圣都。这时船已不见，而杀手马多姆出现了，一定要为妹妹报仇，亚宾冲了上去。而这次马多姆好象是冲着亚宾来的，只有一边的米雪尔看出马多姆的杀气中有一股莫名的悲伤。
所以他用魔法阻止了俩人的打斗。俩人跳入海中，接着被赶来葛维救起。在船上米雪尔谈到他对马多姆的看法。由于巴鲁库特没有自己的海港，所以船靠在了附近的港口。
大家通过密道进入神殿，在神殿后见过最高导师库洛尔，就赶忙将神树叶交给葛维，由他配方。罗蒂丝感激的将鲜红的药水喝了下去。果然不一会儿咒语解开，罗蒂丝恢复了健康。
正在大家高兴的时候，米雪尔要离开，他说要回到自己的世界，要与另一位贤者共同出海，同时修行自己。亚宾与米雪尔依依不舍，而葛维又与米雪尔谈及了在船上的事。
几天后亚宾与葛维在大殿中谈起了在真实之岛上看到的奇特的影像的事。那是关于亚宾今后人生的玄机，其中有观景小屋，麦依，浮在水面上的村庄，奇怪的水路畅通，还有坟场。
葛维听后指出水路畅通的所在可能是花园之丘的天空遗迹，浮在水面上的村庄是西也摩西湖下的企德村，但对于墓地难以想象。
亚宾听后决定到花圆之丘与企德村去看看。罗蒂丝决定与麦依一起去发现真理的真相。因为她曾经与巴斯达负责寻找六件神宝的任务，得知另有四件神宝分别由依顿，斯冠帝亚，奈芙迪斯，杂路这四位精灵守护，而且已经找到二处放宝的地方，一个是花圆之丘，另一个是依顿祠堂。
另有一处可能在企德村。这样一来与亚宾的所见之处基本吻合。经过罗蒂丝的苦苦请求，亚宾终于答应一同前往以上三处，而葛维去寻找杂路的信息。
出发前到最高导师库洛尔处去一次，对他说明要去寻找真实之岛中的启示的意图。库洛尔表示赞同，并告诉亚宾一个好消息，即在神殿下发现一个被称为转位门的特殊的移动装置。
使用它可实现瞬间移动，但只能在巴鲁库特，拔娄亚与非尔汀等地使用。门的钥匙在地下的看守神官那儿，随后库洛尔又将500百络赛交给了亚宾。
告别库洛尔后来到地下室，基本位于神殿的中央，要几经周转才能找到。入地下室后靠右往里走，到底再往下走到底左拐即可遇见神官长。
与其商谈后取得钥匙。用钥匙打开转位之门后，仿佛进入了时空遂道。通过一条漫长狭窄的通道后，到一个类似于宇宙飞船发射中心的地方，站在中央的闪光处选择去处。
企德的斯寇帝亚祠堂，花园之丘的依顿祠堂，观景小屋的奈夫迪斯祠堂，寒冰神殿这四处是剧情发展的方向，可任选一处。如想去观景小屋可选择非尔汀。
到达非尔汀后，出城南行。虽然一路上还有小魔小怪，但以远远不是亚宾的对手。来到乌鲁特村，先到村中的麦依家中，将麦依所遇的不幸告诉他的父母。
麦依的父母强忍悲痛后反而安慰起亚宾来。亚宾在小村外为麦依立了一座坟墓，每个遇见他的人都会安慰亚宾。这使他为战胜邪教增添了信心。
告别麦依的父母，亚宾与罗蒂丝来到了观景小屋。一见观景小屋，亚宾就想起了过去那些年的生活。来到爷爷的墓前，向他倾述了心中的话，并立志要继续走下去。
哀悼过后亚宾想起了在真实之岛看到的爷爷在稻草人中藏东西的情节，随后便在右下方处找到稻草人，从中了解到奈芙迪斯茨堂的入口在诺特斯森林里，到祠堂内还要用爷爷留下的一把钥匙打开祠堂。
原来爷爷就是守护奈芙迪斯祠堂的人。亚宾与罗蒂丝从右上方的一个破栅栏通过，进入了诺特斯森林。在森林中转辗反侧后来到了诺特斯迷宫，直接走到一个有明显方块处站立，这时出现了爷爷的灵魂。
他为亚宾打开了通往奈芙迪斯的通道。（洞内妖魔甚多，入洞须谨慎）入洞后，笔直向上，左拐，再右拐，然后笔直向上走，到顶后再左拐，笔直到底后左拐。
经过一段摸索才能到达奈芙迪亚祠堂。到了祠堂的门口，只见门被锁住，用爷爷的钥匙将门打开。进入祠堂当站在祠堂中心，突然被一道光送到另一处。
笔直向前走通过一自动浮梯后来到了奈芙迪斯的面前。在与其
