- 在ウツギ博士处获取口袋妖怪。
- 从ヨシノクウン的大叔那里获得卵，并将其交给ウツギ博士。
- 在キキョウシティ击败ジムリダ，随后进入口袋妖怪中心获取卵。
- 在ツボミ的塔获得秘传机器5：フラツシュ。
- 进行っながりの洞窟的冒险。
- 在ヒワダタウン遇见ガンテツ，随后前往ヤドン井户击败ロケツト团和ジムリダ。
- 在ウバノの森追逐カモネギ，将其引诱至木炭职人的地点，获得秘传机器1：あいぎり。
- 在コガネシテイ的ラジオ局中获得ラジオカド，击败ジムリダ，并在民家得到ゼニガメのじょうろ。从北ロゲト离开城。
- 对とおせんぼの木使用じようろ。
- 在エンジュシテイ口袋妖怪中心会见マサキ，可以使用タイムマシン（时间机器）。击败舞场中的所有まいこはん，获得秘传机器3：なみのり。
- 在アサギタウン的民家中获得秘传机器4：かいりき，前往烟台。
- 在タンバシテ药屋中获得クスリ，击败ジムリダ，从外面人的手中获得秘传机器2：そらをとぶ。
- 前往アサギ之灯台，击败ジムケダ。
- 从エンジュ到チョウジ。
- 前往チョウジチタウン，击败怒の湖中央的ギャラドス，在土户屋中获得秘传机器6：うずしお，并击败ジムリダ。
- 返回コガネタウンラジオ塔，获得地下的钥匙进入地下通道。
- 返回チョウジチタウン，在冰の拔け道中获得秘传机器7：たきのばり。
- 在フスベシテイ击败ジムリダ，进入りゅうのほこら。
- 返回ワカバタウン会见ツギ博士。
- 进行トジョウの瀑布流程，前往チャンピオンロード。
- 进入セキエイ高原，击败四天王。
- 从ウツギ博士处获得チケツト，乘坐アクア号。
- 在クチバティ的口袋妖怪俱乐部中获得人偶，交给ヤマブキテイ的女孩，并获得定期船票。
- 返回コガネシテト·ラジォ局获得扩张卡，将ラジオ（步话机）的频率调至20，唤醒カビゴン。
- 去发电话，打开电源，开动电车。
- （1）击败クチバシテトジムリダ。之后无需按顺序击败ジムリダ。（2）在ヤマブキシテイ击败ジムリーダ。（3）在タマシシテイ击败ジムリダ。（4）前往ハナダシテイ的ジム，之后去みさき的小屋。从ハナダシム中的水中获得机械部件，击败ジムリダ。（5）在セキチクシテイ击败ジムリダ。（6）前往ニビシテイ，从老爷爷处得到にじいろのハネ，击败ジムリダ。（7）在グレンタウン会见グリン，之后在ふたごじま击败カツラ。（8）在トキワシテイジムリダ。（9）在タムシシティ击败ジムリダ。
- 拜访キド博士。
- 前往チヤンピォンロド。
- 前往シロガネ山，击败レツド。通关后如同《口袋妖怪1》，可进入隐藏的迷宫获取最终最强的怪物，真正的战斗，这时才刚刚开始。
各项能力解说： HP：Hit Point，当数值降为0时，口袋妖怪失去战斗能力。 攻击（こうげき）：攻击力，由普通、格斗、毒、地面、飞行、虫、岩、钢等类型的技能伤害决定。 防守（ぼうきよ）：对攻击的防御，可减少上述攻击的伤害的能力值。 特攻（とくこう）：特殊攻击力，由火、水、电、草、冰、超人、鬼、邪恶、龙等类型的技能伤害决定。 特防（とくぼう）：对特殊攻击的防御，可减少上述攻击的伤害。 速度（すばやさ）：在战斗中非常重要，数值高可取得先手，同等则互相攻击。 个体值不同的口袋妖怪有能力值的差异，想培养强大的妖怪，应尽量选择能力值高的妖怪来养成。培养过程中通过战斗确定妖怪是否具有想象中的实力。 性别：本次加入了性别因素，对妖怪养成来说是个好消息。性别由“攻击”固有值决定，普通口袋妖怪中，攻击固有值为0～7时为雌性，8～15时为雄性。罕见妖怪（只可得一只或出现率极低）不在此限制之内。
全妖怪攻防属性相性表： 接受攻击的怪兽的属性： 普通：普、火、水、电、植物、冰、格斗、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、钢铁、邪恶 火：火、水、电、植物、冰、格斗、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、钢铁、邪恶 水：水、电、植物、火、冰、格斗、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、钢铁、邪恶 电：电、水、植物、火、冰、格斗、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、钢铁、邪恶 植物：植物、水、电、火、冰、格斗、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、钢铁、邪恶 冰：冰、水、电、植物、火、格斗、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、钢铁、邪恶 格斗：格斗、火、水、电、植物、冰、钢、毒、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、邪恶 毒：毒、格斗、钢、水、电、植物、冰、火、地面、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、邪恶 地面：地面、格斗、钢、水、电、植物、火、冰、飞行、超人、虫、岩石、鬼、龙、邪恶 飞行：飞行、格斗、地面、钢、水、电、植物、火、冰、超人、虫、岩石、鬼、龙、邪恶 超人：超人、格斗、飞行、地面、钢、水、电、植物、火、冰、毒、岩石、鬼、龙、邪恶 虫：虫、格斗、钢、飞行、地面、水、电、植物、火、冰、超人、岩石、鬼、龙、邪恶 岩石：岩石、格斗、钢、水、电、植物、火、冰、飞行、超人、虫、地面、鬼、龙、邪恶 鬼：鬼、格斗、飞行、地面、钢、水、电、植物、火、冰、毒、岩石、超人、虫、龙、邪恶 龙：龙、格斗、飞行、地面、钢、水、电、植物、火、冰、毒、岩石、鬼、超人、虫、邪恶 钢铁：钢铁、格斗、飞行、地面、毒、水、电、植物、火、冰、鬼、岩石、龙、超人、虫、邪恶 邪恶：邪恶、格斗、飞行、地面、钢、水、电、植物、火、冰、毒、岩石、鬼、龙、超人、虫
