在东亚区域成功击败来岛之后，杭州同业公会将授予你一份竹艺品组合说明书的任务。在大阪的酒馆中，你邂逅了一位受伤者，他透露一个来自葡萄牙的宣教团似乎与走私集团有所勾结，指示你前往澳门酒馆搜集情报。抵达澳门后得知宣教团将于次日抵达，你前往码头发现宣教团实为假冒，随后至总督府揭露他们的阴谋。返回大阪酒馆，酒吧女老板指引你前往遗迹金阁寺。
金阁寺的高僧指示你前往位于最东北的村子寻找霸者之证的线索。在前往北海道（北纬42度东经141度）的途中，你抵达科尔夫（北纬60度东经165度），并获得了唐代的竹艺品。继续前往东南亚，在马尼拉广场，一位水手告知你库恩正计划破坏你与丽璐商会的关系。在马六甲你遇到了赫德拉姆和卡米尔，得知丽璐在雅加达，并且误信了库恩的诽谤。在雅加达与丽璐相遇，但她依旧不相信库恩的恶行。与库恩宣战击败他后得知麻六甲有人寻找。
在麻六甲码头，水手要求你将一位人物送至关岛（北纬15度东经145度），抵达后获得含有乳液的壶。返回麻六甲同业公会，接受寻找鱼翅的任务。在东南亚海域多加巡游，遭遇鲨鱼并击败，若同时遇到塞维和阿尔，可得到原产物鲨鱼幼苗，将其交给泗水的交易所后可换取鱼翅。购买船舱鱼翅后，在麻六甲同业公会发现遗迹，再次进入遗迹可获得古代王国钱币。
前往印度洋在马斯客特遇到伍丁，他建议与你结盟对抗纳哥普尔，你选择不同意并立刻与他交战。击败伍丁后在卡利亥特酒馆获得不枯萎的莲叶。前往巴斯拉的造船厂，老板要求你寻找精通造船技术的欧洲人，找到查理、杰那斯、曼努埃尔和铁礼列后，将他们带到巴斯拉造船厂。协助研究出双层装甲方法后，同业公会老板赠予你贵霜朝的大盘。
前往非洲在摩加迪休与埃斯皮诺沙交战。在马达加斯加发现东亚可以新建交易港。返回杭州查理要求留下建设淡水新城市，你被派往地中海购买五船舱葡萄酒。购买后前往淡水（泉州右侧），交易所出现，不断投资后，总督府、造船厂、同业公会、酒馆、旅馆等设施相继出现。返回非洲击败埃斯皮诺沙商会后，在索法拉获得神秘石板下半部。
前往圣乔治同业公会指示你购买五船舱铠甲、五船舱洋枪和两船舱大炮，购买后出现遗迹，获得神秘石板上半部。前往地中海在拉斯帕马斯酒馆遇到拉斐尔，了解地中海的局势。在地中海游历一圈后，在塞尔维亚附近遇到拉斐尔与巴鲁迪斯交战，协助他获胜后前往塞尔维亚酒馆，得知需前往伊斯坦堡同业公会。
抵达伊斯坦堡，同业公会要求你在30天内往返伊斯坦堡与休达，完成任务后出现遗迹，获得黄铜制煤油灯。势力排名首位时，前往亚历山大遗迹获得印有图案的布。前往新大陆在圣约翰遇到马尔德纳德，与他结盟对抗埃斯康特。击败埃斯康特后，在委拉克路斯总督府得知霸者之证的线索位于新大陆西岸的村庄。途经里约热内卢（南纬22度东经43度）、蒙特维多（南纬38度东经60度）、法耳巴拉索（南纬38度东经73度），在客劳（南纬8度东经78度）获得太阳圆纹的刀鞘。
前往哈瓦那同业公会要求你对抗海上的幽灵船，击败后回哈瓦那出现遗迹，获得典礼用的小刀。前往北海在南特得知理查投靠了克利福德，导致明朝失去大部分占有率。在阿姆斯特丹附近遇到丽璐被克利福德舰队欺凌，协助她后与克利福德交战。击败克利福德后，在伦敦码头获得他的信件，带至阿姆斯特丹酒馆获取红色染料。伦敦同业公会要求你前往非洲寻找治疗坏血病的药物，找到莱姆的滴汁（北纬0度东经6度）后借给同业公会，30天后返回同业公会，出现遗迹，获得老旧的羊皮纸。
集齐七海的霸者之证后，返回杭州，目睹结局画面。
