寒风刺骨大雪纷飞，孤独地在雪地中行走，虽踏碎冰雪，却难消寂寞。此时阿飞发现雪地中有一串脚印，恶劣天气下，除自己外，竟有人独自在雪原上前行。一辆马车映入眼帘，车内有一咳嗽不止的病人，而车前的大汉却精神抖擞。李寻欢邀请阿飞上车共饮，但阿飞因不愿轻易受人恩惠而婉拒。李寻欢提出若阿飞买得起酒，便请他喝一杯，阿飞答应。李寻欢与铁传甲离开，阿飞心中对那位病人念念不忘，二人之间奇妙的友情自此开始。
抵达无名小镇，来到街道上的小酒馆，目睹“碧血双蛇”的白蛇以更快一招剑法震慑诸葛雷，并要求他交出“包袱”。白蛇得意挑衅之际，阿飞步入酒馆。他提出以五十两银子换取白蛇性命，白蛇怒，却遭阿飞闪电一剑刺死。黑蛇惊慌逃走，阿飞捡起银子，诸葛雷从背后偷袭，意图挽回面子。小李飞刀及时出手，杀死诸葛雷。阿飞请李寻欢喝酒，履行先前承诺。
在李寻欢的马车内，阿飞自报姓名，两人一见如故。马车行至雪人立处，阿飞用剑挑开雪人，发现是逃走的黑蛇尸体。金狮镖局的查总镖头带领虞二先生、“极乐峒”四童子等人出现，怀疑李寻欢杀死诸葛雷取走“包袱”，李寻欢不想辩解，亦不愿武力解决，提出一小时后答复。为避免连累阿飞，李寻欢与他告别。阿飞知晓李寻欢心意，前往上方小酒店解决问题。
至小酒店先杀查总镖头，再与虞二先生和“极乐峒”四童子激战。进入厨房发现洪汉民拿走包袱，将其击败并绑在椅子上留给李寻欢审问。走出酒店来到后雪地，听到惨叫，发现花蜂被“千手罗刹”和施耀先、潘小安联手杀害。继续前行见到潘小安马车驶去，潘小安被杀。进入岔道与施耀先相斗，将其杀死。为保护金丝甲，阿飞取下，准备日后归还李寻欢。发现帖子得知洪浩邀请去牛家庄处理公案，决定前往。
至牛家庄小酒店，遇酒局，与其对饮，获得钱后邀请其去小酒店喝酒。进入小酒店中原八义邀请阿飞为一庄武林公案作证，阿飞出手阻拦，打败赵正义等人，救走铁传甲，来到保定沈家祠堂。
铁传甲担心李寻欢，阿飞决定在兴云庄梅花岭前守候。有人呼救自称梅花盗，劫持林仙儿。杀死梅花盗后，与林仙儿一同解救李寻欢。阿飞想带走李寻欢，却因人手过多而失败，被点穴的李寻欢成为累赘。少林寺心眉大师赶来，阿飞打败田七属下后离开，坚定救出李寻欢的信念。
与林仙儿约定次日再探消息，回到祠堂。第二天林仙儿告知李寻欢即将被押往少林公审，救人在白天最好。阿飞出祠堂找到林麻子，逼其带去找李寻欢。至兴云庄右边小屋，发现李寻欢不在，而是田七等人。与田七及门人、赵正义、少林僧人激战，心眉大师赶来，先与僧人大战，后与心眉一战。阿飞受伤跑进梅花岭，心眉劝众人莫追。
阿飞跑至冷香小筑，遇见铁笛先生，一战受伤，铁笛先生放走阿飞。阿飞昏死过去，被林仙儿救醒。林仙儿告知李寻欢已被押走，阿飞决定与林仙儿追赶。至保定城口林仙儿备好马车，来到独立客栈。与林仙儿告别，遭遇青魔手伊哭，伊哭被杀。与林仙儿回到客栈，得知李寻欢受困少林寺，决定假冒梅花盗作案。
回到林仙儿房间，商量后决定回保定找富不仁之人下手，选择张善人。至张善人家战后回到祠堂。决定次日再找富不仁之人。翌日至申老三家，告知其恶行，决定晚上动手。入夜进入申老三宅，遭遇少林僧人埋伏，被押至少林威胁李寻欢，无果。醒来发现自己被押在少林僧人房中，记挂李寻欢，向外跑去。
至圆坛处遇到逃走的少林叛徒心鉴，成为其剑下之魂。真相大白拒绝众僧挽留，执意与李寻欢下山。李寻欢想回兴云庄，阿飞决定找林仙儿，两人一起回到保定城。至兴云庄前李寻欢怀疑梅花盗是林仙儿，让阿飞自己处理。阿飞来到冷香小筑，质问林仙儿，两人归隐山林。
至梅林过着平淡生活。一年后李寻欢来访，两人重逢。林仙儿回来李寻欢试探她，林仙儿不为所动。两人交谈得知阿飞生活平淡空虚，林仙儿背着阿飞鬼混。李寻欢与阿飞交谈，得知阿飞睡眠早，晚饭汤中的笋子是李寻欢不爱吃的，趁林仙儿不在时换给阿飞。吃过晚饭阿飞入睡。
半夜阿飞被林仙儿叫醒，林仙儿衣衫不整，称李寻欢想借酒行凶，她抵死不从。两人决定换一个地方隐居，至山村后的枯林，阿飞伐木，新居建成。休息数日林仙儿让阿飞去杀荆无命，因为荆无命要杀李寻欢。阿飞以打败荆无命为目标，离开枯林。
至恩平镇至小镇算命处，遇见荆无命和金钱帮众，打败金钱帮众后，发现荆无命已离开。至镇外坟场发现马车的辙印，至丹阳，至如云客栈，调查后得知人不见了，找车夫问清，至恩平镇交错的巷弄，发现马车的踪迹。
至地图左上角，遇荆无命和龙啸云父子，阿飞与荆无命一战，不敌，荆无命未杀他，阿飞继续追寻李寻欢下落。生命值降至零，吃补药无效，一路存盘狂奔至山村枫林中严家小屋，至严大妈，答应帮她把亲手制作的铜钱背心给在金钱帮的儿子，出门后再进去住两次，体力全恢复。
至大宅院在后花园屋子地板下找到李寻欢。龙啸云带荆无命来带走李寻欢，荆无命自残左臂离开。阿飞告知李寻欢是林仙儿要他来相救的，李寻欢见阿飞被林仙儿欺骗得更深，心中矛盾，决定与阿飞一起回去见林仙儿。
回到恩平镇两人决定到饺子馆喝一杯，看见林铃铃等待李寻欢，旁边还有一个气宇不凡的白衣人，正是兵器谱上排名第五的吕凤先。吕凤先想五名顶尖高手挑战，但现在只剩四名，阿飞明白吕凤先排除掉的那个人正是自己，重新燃起斗志。李寻欢让铃铃请求吕凤先假装败给阿飞，以恢复阿飞的自信。
阿飞提出交手，吕凤先让阿飞到坟场相会，先行离去。至恩平镇外的坟场，阿飞向吕凤先挑战，吕凤先卖个破绽输了一招，李寻欢鼓励阿飞，两人至恩平镇的醉泉客栈喝酒庆祝。翌日阿飞至大堂喝酒，看见孙白发祖孙、荆无命、上官飞等人依次从门口走过，起身尾随，李寻欢也悄悄跟在后面。
至镇外的坟场，看见阿飞站在坟堆后面观看，走到阿飞旁边站住，见荆无命和上官飞决斗，荆无命用右手剑杀掉上官飞。阿飞惊惧不已，李寻欢鼓励阿飞，重新鼓起信心。阿飞决定带李寻欢去见林仙儿。离开恩平镇后，前往枯林，发现奄奄一息的铃铃，得知铃铃带着吕凤先来杀林仙儿，被林仙儿所媚惑而不忍下手，杀害铃铃。
阿飞明白是李寻欢让吕凤先来杀林仙儿，但被林仙儿蒙蔽的他又怎能理解李寻欢为了挽救自己而付出的一片苦心，冲动地要和李寻欢断绝朋友之谊。阿飞冲出去找林仙儿，至枯林深处，发现林仙儿与上官金虹在一起，林仙儿说是上官金虹救了她，阿飞答应帮他杀一个人作为报答，上官金虹带阿飞走，至金钱帮分舵。
至最里层进客房，上官金虹走后，林仙儿猜出上官金虹是让阿飞杀龙啸云父子，因为这样他们可以不结拜，同时又让阿飞成为替罪羊，而李寻欢又不能找他报仇。阿飞心知肚明，夜晚，林仙儿见阿飞睡着便走了出去。
阿飞并未睡着，便出去寻找，遍找没找到，返回客房，碰上上官金虹，他揭穿林仙儿，并说要带阿飞去个好地方。至安乐窝一群女子将阿飞包围，阿飞喝得酩酊大醉。翌日金钱帮众传书让阿飞到丹阳杀两个穿紫衣的人，至丹阳如云客栈后面的高贵厅，发现上官金虹和龙啸云的结拜仪式正在进行，阿飞冲上去杀龙啸云，失手，上官金虹与龙啸云翻脸，龙小云自断左腕后和父亲离去。
阿飞想喝酒被上官金虹羞辱，李寻欢上前帮助阿飞，阿飞自觉没脸见他，大吼一声冲了出去，想逃，却不知逃往何处。至丹阳末见到严大妈的儿子，将背心给了他，转达想让他回家的话，提醒他上官金虹下令见到阿飞格杀勿论。至分舵的安乐窝，喝得酩酊大醉。
醒来浑身发烫，原来是孙白发把他从安乐窝中带回了小屋，要把他的酒毒蒸出来，李寻欢、孙小红也来了，林仙儿也回来了。林仙儿花言巧语地打动了阿飞，阿飞再次接受了她，赶走了李寻欢等人。不久金钱帮众赶来杀林仙儿，揭露了她，阿飞保护不了她。这时荆无命来了，将为首之人杀了，林仙儿对阿飞说了实话，就跟荆无命走了。
阿飞受伤至深，不愿迈出家门。此时李寻欢在长亭赴决斗之约，与上官金虹决斗，荆无命拎着林仙儿出现，众人都不愿杀林仙儿，李寻欢提出更换地点，与上官金虹一起前往金钱帮总舵。林仙儿讽刺孙小红作了错事，决定回去找阿飞。她走了之后林诗音出现，让孙小红找阿飞去救李寻欢，忏悔她未将怜花宝鉴给李寻欢，同时托她照顾李寻欢，因为她决定和小云一起离开这里。
林仙儿回到小屋，请求阿飞的谅解，她认为只要她回头，阿飞一定会接受她的。可是她错了。经过多日的反思，阿飞终于醒了，又成了以前的阿飞，他毅然推开了林仙儿，向过去的人生告别，大踏步地向外走去。孙小红在外面等他，要阿飞和她一块去金钱帮救李寻欢。阿飞答应了。两人决定先去保定城打探消息。
至兴云庄门前，遇到一群金钱帮众，打败后却未得知金钱帮的位置。至丹阳至富贵厅，遇金钱帮分舵舵主，打败后得到金钱帮的地点。至大地图的金钱帮总舵，一路杀至门口，发现大门是钢精所成，无法从外部打开。两人感叹世道不平时，杀死上官金虹后出门，李寻欢走了出来，欣喜地发现阿飞终于摆脱了枷锁。
阿飞走了进去，见到荆无命正在搬运上官金虹的尸体，就向荆无命提出挑战，战胜荆无命证明了自己。回到长亭阿飞和李寻欢定下三年之约，三年后他会回来喝李寻欢和孙小红的喜酒。小李飞刀终于有了快乐的归宿，年轻的飞剑客还将继续去磨练，完成属于自己的传奇。李寻欢和孙小红牵着手，看着阿飞孤独的背影慢慢远去。
