（1）XelNaga的奥秘：XelNaga，这一宇宙中的混种生物，由宇宙中最完美的两个种族融合而成。虽然Protoss的寿命可达千年，但在XelNaga面前却微不足道。但是即便如此，XelNaga的寿命同样是有限的。在每一代XelNaga衰亡之前，他们会挑选两个有潜力的种族进行改造和进化，一个赋予纯粹的外形，一个赋予纯粹的本质。经过漫长岁月，这两个种族最终融合，新的XelNaga由此诞生。
（2）神器的秘密：关于神器为何能净化Kerrigan，许多人感到困惑。在游戏中莫比斯的领袖纳鲁德博士声称这神器是XelNaga所造。如果此言非虚，那么神器的原理相当简单：吸收并储存周围Protoss和Zerg的基因和生命能量。XelNaga在银河中留下了许多神殿遗迹，这些遗迹功能多样，但大多数都有吸收生物基因和生命能量的作用，用于复活XelNaga。官方小说《XelNaga的阴影》中对此有详细描述。
这些设施控制严格，不会对Protoss和Zerg以外的生物产生影响。例如一次意外中，一个人类被神殿分解吞噬，但很快又完好无损地出来。所以这些设施会严格保护P和Z以外的生命组织。神器相当于小型移动版神殿，吸收Kerrigan身上的Zerg基因和能量，将其重组为人类形态。单纯的吸收Zerg基因并不能净化Kerrigan。韩森博士的研究也指出，初期被Zerg病毒感染的人可能还有救，但一旦病毒彻底改写细胞和基因，则无药可救。XelNaga却拥有这样的科技。
（3）幕后人杜兰的身份：纳鲁德博士就是杜兰。将Narud这个词反过来写就是Duran，这并非巧合，而是确凿的事实。在争夺莫比斯数据核心的一关中，Kerrigan明确表示已经看穿了纳鲁德博士的把戏，并知道神器的真正用途。Kerrigan从一开始就知道神器是用来对付她的，并且看穿了杜兰的身份。尽管纳鲁德博士试图蒙混过关，但Kerrigan并未直接拆穿他。
（4）皇帝阿克图勒斯·曼斯克的身影：游戏最初和最后与泰克斯说话的是皇帝阿克图勒斯·曼斯克。幕后为何有他的身影？下文将具体讨论。
