在《星际争霸2》的战役模式中，有许多隐藏的关卡和彩蛋等待玩家探索。以下是一些已知的隐藏内容：
“一探究竟”隐藏关卡： 在“Media Blitz”关卡中，玩家需要控制奥丁Odin，前往地图右下角。摧毁漂浮平台上的红色平民建筑，一条通往敌方小基地的路就会显现。当建筑物被摧毁后，“隐藏文档”会出现，玩家可以用任意地面部队捡起它，之后继续正常通关。这个隐藏关卡在开始菜单中将会变为可进入状态。在前往Char星球之后，就不能再玩这个隐藏关卡，因为需要穿越到另一个星球。所以玩家需要在登入Char星球之前，在载入菜单中加载游戏来玩这个隐藏关卡。
太空打飞机消遣小游戏： 在Hyperian太空船的酒吧里，有一个街机，玩家可以通过左键点击来玩太空打飞机的小游戏。
自爆生物： 反复点击任何中立生物，可以引发自爆，这是一个经典的彩蛋。
隐藏对话： 通过左键反复点击单位，可以听到隐藏的对话。
魔兽舞蹈： 在星舰酒吧的左上角红色全息照片中，有一个红色雌性生物正在跳魔兽中夜精灵女性的舞蹈。
音乐广告： 在神族任务中观看电视时，可以看到为LVL800ETC播放的音乐广告。这些歌曲都来自一个名为LVL800ETC的金属乐队，该乐队由暴雪员工创建，专为星际争霸和魔兽世界献声。乐队的主唱是暴雪美术部总管。
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