朝代更迭系统是文明6秦始皇特有的一个系统，这个系统模拟了历史中中国的朝代更迭现象。玩家通过以秦始皇为领导的文明，可以通过各种方式推动朝代的更迭，并获取更迭后的各种奖励。
朝代更迭系统的核心是两个元素，一是朝代，二是朝代更迭。朝代指的是玩家所处在的元游戏阶段，比如夏朝、商朝个等等，每个朝代依次递进，每个朝代有其特有的奖励。当玩家在当前朝代的所有任务都完成后，就会触发朝代更迭，进入下一个朝代。朝代的种类包括夏朝、商朝、周朝、汉朝、唐朝、宋朝、明朝和清朝，每个朝代的具体奖励分布如下。夏朝：获取一个工程师，可以用于建设工程。商朝：获得一个城市的建设权，可以在该城市建设建筑。周朝：可以提升一个区的建设速度。汉朝：可以提升一个科研项目的研究速度。唐朝：可以提升对一个资源的利用率。宋朝：可以提升对一个商业点的利用率。明朝：可以提升对一个军事队伍的利用率。清朝：可以提升对一个文化项目的发展速度。
触发朝代更迭的条件有几个，玩家需要完成当前朝代的所有任务，包括对指定城市的占领，或者发展一个特定的科研项目。玩家需要拥有足够的“朝代点数”，这些点数可以通过各种活动获得，比如发展经济、进行交战等。还需要满足一些特定的时间条件，如在指定的时期内完成指定数量的任务。当满足上述条件后，会进入朝代更迭阶段。在这个阶段，玩家可以选择在朝代更迭后获得一个新的奖励，包括新的科技、新的建筑、新的政策等等。玩家将进入下一个朝代。
