除了耕作、养殖、挖掘和社交等核心玩法外，《星露谷物语》还隐藏着许多不为人知的秘密任务，为游戏的探索增添了无数乐趣。这些隐藏任务往往还与游戏中的人物、历史和世界观紧密相连，让玩家在探索的过程中，更加深入地了解这个充满魅力的世界。
在游戏的西部地区靠近巴斯的房子有一个未标记的任务，玩家可以在那里发现一片小小的苹果园。通过与园内的老人对话，玩家会被告知需要为他寻找特定的苹果种子。任务的线索相对模糊，要求玩家深入研究和探索。玩家需要通过交换、钓鱼或是在神秘商人处购买，才能找到这种罕见的苹果种子。完成这个任务不仅可以获得金钱上的奖赏，还能解锁一段独特的剧情。
在游戏世界里，有一个被玩家称为“军团”的秘密组织。玩家可以在探索过程中偶然发现一个被遗忘的货箱，里面藏有一封信和一份神秘的任务。任务内容是找到并送达一份特殊的礼物给某个NPC，但任务描述故意留下了许多悬念。玩家需要仔细解读线索，最终找到目标NPC并完成交付，才能揭晓这个秘密组织的更多信息。
在星露谷的东南角的海滩上，有一座奇怪的雕塑，似乎与周围环境格格不入。这座雕塑背后实际上隐藏着一个复杂的解谜任务，需要玩家在特定的时间，使用特定的物品来与之互动。这个过程中，玩家将需要搜集零散的线索，跨越整个星露谷来寻找解谜的关键。成功解开谜题不但能获得丰厚的奖励，还会揭露一段关于星露谷历史的故事。
《星露谷物语》中的钓鱼系统是游戏的重要组成部分之一，在众多的鱼种中，有几种传说中的鱼只能在特定的条件下才会出现，比如特定的季节、天气、时间或地点。这些条件通常被隐藏在NPC的对话中或是遗留在世界各处的书籍和笔记里。玩家需要仔细收集这些情报，才能成功钓到这些珍稀鱼种。完成这类任务会给玩家带来巨大的成就感，并有机会获得独特的奖励品。
在玩家的农场上，隐藏着一个容易被忽略的小洞穴。在特定的条件下，这个洞穴会成为一个复杂迷宫的入口。玩家需要在迷宫中寻找线索，解决谜题，并和地下生物互动，才能找到它的秘密宝藏。这个洞穴里不仅有稀有的矿石和宝石等资源，还可能遇到唯一的怪物。挑战并完成这个隐蔽任务，玩家可以获得巨大的财富，甚至是游戏中独一无二的物品。
《星露谷物语》里的隐藏任务有很多，包括西部地区里苹果园的苹果种子任务、秘密组织“军团”任务、海滩雕塑解密任务以及钓鱼传说任务等。上述介绍的隐藏任务只是冰山一角，游戏中还有更多的秘密等待玩家去揭露。这些任务不仅丰富了游戏的内容，更增加了探索的趣味性，使玩家能够在享受乡村生活的也能体验到解谜的乐趣。
