在星穹铁道的某个不起眼的角落，玩家可以接到一个关于寻找失落太空站的任务，这个任务并不会在常规的任务列表中出现，玩家需要在探索某个特定星系时偶然间通过对话或是特定物品触发，这个任务将带领玩家穿越几个未知的星系，追踪那些古老的信号，最终找到失落已久的太空站，在这一过程中，玩家不仅要面对未知的危险，还要解决一系列的谜题，才能揭开太空站失落的真相。
这是一个隐藏的副本任务，玩家在访问一个繁华星球的市场时，有机会触发，一位神秘的商人会邀请玩家参与他的赝品贸易，任务涉及到各种稀奇古怪的物品，甚至是违禁品，玩家必须巧妙地避开银河巡警的眼睛，完成一系列的走私活动，这个任务考验玩家的策略和风险评估能力，成功之后不仅能获得丰厚的奖励，还可能开启新的市场渠道，为玩家今后的交易带来便利。
在探索一个遥远古老的星球时，玩家可能会偶然发现一处被遗忘的遗迹，这将启动一个长期探索任务，这个任务要求玩家收集散落在不同星系的线索，逐渐拼凑出遗迹的历史和秘密，这个探索过程充满未知，玩家需要与各路人马打交道，从他们口中获取信息，甚至可能涉及到一些小规模的战斗，最终揭开遗迹秘密的奖励非常丰富，不仅有稀有资源，还有可能是一艘独一无二的太空船。
在游戏深处隐藏着一个关于黑暗物质研究的任务线，但触发这个任务的条件极其苛刻，需要玩家在多个特定星系完成一系列复杂的挑战，这个任务涉及大量的科学研究和实验，玩家需要收集稀有材料，建造特殊设备，甚至与银河中的顶尖科学家合作，共同揭开黑暗物质的秘密，成功完成这个任务，将为玩家的科技发展和资源收集带来革命性的进步。
在达到游戏后期，玩家有机会触发一个影响银河系和平的巨大任务，这个任务要求玩家跨越数个星系，与各种文明进行交涉，解决长期存在的冲突和纠纷，这不仅是一个对玩家交际能力的考验，也需要玩家拥有强大的舰队作为后盾，完成这个任务不仅能获得巨大的声望和资源奖励，还可能改变游戏内部的政治格局，为玩家在星际间的行动带来更多的便利。
在星穹铁道中，寻找失落太空站是一个隐藏任务，繁华星球市场的赝品贸易是一个隐藏任务，古老星球上被遗忘的遗迹也是一个隐藏任务，还有一个条件比较难触发的黑暗物质研究隐藏任务，后期玩家还会触发一个银河系文明交涉的任务，这些任务不仅能够测试玩家的策略和解谜能力，还提供了丰富多样的故事线和背景世界的深度，玩家可以一一进行探索。
